DNA依赖的蛋白激酶抑制剂STL127705的合成工艺研究

景云荣 魏继承

引用本文: 景云荣, 魏继承. DNA依赖的蛋白激酶抑制剂STL127705的合成工艺研究[J]. 化学通报, 2019, 82(9): 860-863. shu
Citation:  Jing Yunrong, Wei Jicheng. Study on the Synthesis of DNA-PK Inhibitor STL127705[J]. Chemistry, 2019, 82(9): 860-863. shu

DNA依赖的蛋白激酶抑制剂STL127705的合成工艺研究

    作者简介: 景云荣    女, 讲师, 主要从事药物合成研究。E-mail:swxjyr@126.com;

  • 基金项目:

    黑龙江省人社厅留学回国人员择优资助项目和牡丹江师范学院科研项目(MNUB201405)资助

摘要: DNA依赖的蛋白激酶(DNA-PK)是肿瘤治疗的一个潜在靶点,其抑制剂具有增强放化疗敏感性的作用。STL127705是一种有效的DNA-PK抑制剂,本文采用逆合成分析,以2-甲基硫-4-氯嘧啶-5-基甲酸乙酯为起始原料,先后经过氨化、水解、酰胺缩合、合环、氧化、取代等6步反应制备得到目标化合物,总收率为36.8%,纯度达到95.5%,产物结构通过1H NMR、13C NMR、MS等表征。

English

  • DNA依赖的蛋白激酶(DNA-PK)是由DNA依赖的蛋白激酶催化亚单位(DNA-PKcs)与Ku蛋白(由Ku70和Ku80组成的蛋白异构体)组成的一种蛋白复合物,其功能是启动DNA双链断裂的非同源末端连接修复(NHEJ)[1~4]。DNA损伤诱导剂和放疗已经广泛应用于临床肿瘤治疗,其抗肿瘤机制为诱导肿瘤细胞发生致死性的DNA双链断裂(DSB),DSB主要是通过非同源末端连接来修复的,因此在此修复过程中起关键作用的DNA-PK的抑制剂就具有增强放化疗敏感性的作用[5, 6]。奥拉帕尼是一种多聚二磷酸腺苷核糖聚合酶(PARP)抑制剂,其可阻断参与修复受损DNA的酶[7~9]。2014年,美国FDA批准奥拉帕尼应用于BRCA基因缺陷相关的卵巢癌的治疗。随着奥拉帕尼的临床获批,DNA修复抑制剂引起了广大研究者的注意,越来越多的新型DNA修复抑制剂被研发并投入到临床试验当中。研究发现,STL127705是一种具有嘧啶并嘧啶二酮骨架结构的DNA-PK的抑制剂,其对肿瘤细胞的杀伤效应不大,但其能够通过阻断DNA修复通路,极大地增强DNA损伤诱导剂或放疗的抗肿瘤功效[10]

    有关STL127705的合成方法之前未见报道,从其化学结构分析,可由3, 4-二甲氧基苯乙胺与含有嘧啶并嘧啶二酮结构的衍生物缩合而成;嘧啶并嘧啶二酮结构化合物可由4-氨基嘧啶-5-酰胺衍生结构合环反应制得;4-氨基嘧啶-5-酰胺衍生物可由相应的4-氨基-5-嘧啶甲酸衍生物与3-氟苯胺酯化缩合来得到(图式 1)。

    图式 1

    图式 1.  目标化合物STL127705的逆合成路线分析
    Scheme 1.  Retrosynthesis of target compound STL127705

    通过对目标化合物的逆合成分析,本文设计的合成路线是以2-甲基硫-4-氯嘧啶-5-基甲酸乙酯为起始原料,先对其4位进行氨化生成化合物1,再水解化合物1中的甲酸乙酯,游离的羧酸基团与3-氟苯胺进行缩合酰化反应,生成化合物3。化合物3与二(三氯甲基)碳酸酯发生合环反应,生成化合物4。然后将化合物4中的甲硫醚基团氧化为甲磺酰基,化合物5与3, 4-二甲氧基苯乙胺反应生成最终的目标化合物STL127705(图式 2)。

    图式 2

    图式 2.  本文报道的目标化合物STL127705的合成路线
    Scheme 2.  Synthetic route of target compound STL127705 reported in this paper

    实验中相关化学试剂均为国产分析纯级,无水溶剂用常规方法干燥处理。使用E. Merck (GF254) 0.25mm TLC硅胶板监测反应;柱层析分离纯化采用快速制备仪器Biotage Isolera I,所用的硅胶为300~400目;反应收率由过柱纯化后计算而得;熔点采用X4型显微熔点仪测定;质谱通过LCQ-Deca XP/Ad型(Thermo Electron)离子阱质谱仪测定,离子源采用电喷雾离子化(ESI);1H NMR和13C NMR谱由Bruker Avance Ⅲ 400MHz核磁共振波谱仪测定。

    1.2.1   化合物1的合成

    将5.00g(21.5mmol)2-甲基硫-4-氯嘧啶-5-基甲酸乙酯溶于20mL四氢呋喃,向反应液中加入5mL 25%氨水溶液,室温下反应2h,TLC监测至反应结束后加入30mL饱和氯化铵溶液淬灭反应,用乙酸乙酯(20mL×3)萃取,合并有机相,经无水硫酸钠干燥,过滤,滤液减压浓缩,残留物经柱层析纯化(乙酸乙酯/石油醚,1:1(体积比,下同))得到白色固体4.12g,收率89.3%,熔点130~131℃。ESI-MS m/z:214.0[M+H]+1H NMR (400MHz,DMSO-d6)δ:8.61(s,1H,H-4),7.84(s,2H,-NH2),3.47~3.41(q,J=6.8Hz,2H,-OCH2CH3),2.45(s,3H,-SCH3),1.04~1.00(t,J=6.8Hz,3H,-OCH2CH3)。

    1.2.2   化合物2的合成

    将4.12g(19.3mmol)化合物1溶于15mL甲醇,滴加3mL 0.50g/mL氢氧化锂水溶液,在50℃条件下反应5h,TLC监测至反应结束,加入30mL饱和氯化铵溶液,用乙酸乙酯(20mL×3)萃取,合并有机相,经无水硫酸钠干燥,过滤,滤液减压浓缩,残留物经柱层析纯化(乙酸乙酯/石油醚,1:3)得到白色固体3.25g,收率91.0%,熔点122~124 ℃。ESI-MS m/z:183.9 [M-H]-1H NMR (400MHz,DMSO-d6)δ:13.17(s,1H,-COOH),8.54(s,1H,H-4),7.89(s,1H,-NH2),7.82(s,1H,-NH2),2.47(s,3H,-SCH3)。

    1.2.3   化合物3的合成

    将3.25g(17.6mmol)化合物2和8.01g(21.1mmol)2-(7-氧化苯并三氮唑)-N, N, N′, N′-四甲基脲六氟磷酸酯(HATU)溶于20mL干燥的N, N-二甲基甲酰胺(DMF)中,在氮气保护和室温条件下,向反应液中加入4.6mL(26.4mmol)N, N-二异丙基乙胺(DIPEA),滴加完毕后反应10min,再向反应液中加入2.40g(21.1mmol)3-氟苯胺,室温下反应12h,待反应结束后向反应液中加入30mL饱和氯化铵溶液,用乙酸乙酯(20mL×4)萃取,合并有机相,经无水硫酸钠干燥,过滤,滤液减压浓缩,残留物经柱层析纯化(乙酸乙酯/石油醚,2:3)得到淡黄色固体4.55g,收率93.0%,熔点145~147 ℃。ESI-MS m/z:279.4 [M+H]+1H NMR (400MHz,DMSO-d6)δ:10.33(s,1H,-CONH-),8.65(s,1H,H-4),7.82(s,2H,-NH2),7.65(dt,J=11.8、2.2 Hz,1H,H-2’),7.49~7.43 (m,1H,H-6’),7.39 (dt,J=15.0,7.5Hz,1H,H-4’),6.94 (ddd,J=8.1、2.5、1.8 Hz,1H,H-5’),2.48 (s,3H,-SCH3)。

    1.2.4   化合物4的合成

    在氮气保护和冰浴条件下,将4.55g(16.4mmol)化合物3和20g(65.6mmol)二(三氯甲基)碳酸酯溶于30mL干燥的四氢呋喃中,滴加5.7mL(32.8mmol)DIPEA,反应2h,TLC监测至反应完成后向反应液中加入50mL饱和氯化铵溶液,用乙酸乙酯(30mL×4)萃取,合并有机相,经无水硫酸钠干燥,过滤,滤液减压浓缩,残留物经柱层析纯化(乙酸乙酯/石油醚,1:1)得到淡黄色固体4.43g,收率88.9%,熔点139~140 ℃。ESI-MS m/z:305.5 [M+H]+1H NMR (400MHz,DMSO-d6)δ:12.48(s,1H,H-7),8.93(s,1H,H-4),7.60~7.50(m,1H,H-4’),7.35~7.24(m,2H,H-2’,H-5’),7.21(d,J=7.9Hz,1H,H-6’),2.61(s,3H,-SCH3)。

    1.2.5   化合物5的合成

    在冰浴条件下,将4.43g(14.6mmol)化合物4溶于30mL干燥的二氯甲烷中,慢慢地向反应液中加入14.8g(73.0mmol)85%间氯过氧苯甲酸(m-CPBA),待固体溶解后,撤去冰浴,室温下反应12h,TLC监测至反应完成,向反应液中加入50mL饱和碳酸氢钠溶液,用二氯甲烷(30mL×4)萃取,合并有机相,经无水硫酸钠干燥,过滤,滤液减压浓缩,残留物经柱层析纯化(乙酸乙酯/石油醚,1:2)得到黄色固体3.45g,收率70.4%,熔点142~143 ℃。ESI-MS m/z:337.0 [M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:13.18(s,1H,H-7),9.32(s,1H,H-4),7.58(dd,J=14.7、8.0 Hz,1H,H-4’),7.39~7.30 (m,1H,H-5’),7.26 (d,J=9.5Hz,1H,H-2’),7.22(d,J=8.0Hz,1H,H-6’),3.48(s,3H,-SO2CH3)。

    1.2.6   目标化合物STL127705的合成

    在氮气保护下,将3.45g(10.3mmol)化合物5和2.85g(15.5mmol)3, 4-二甲氧基苯乙胺溶于10mL N, N-二甲基乙酰胺(DMA)中,80℃反应2h,TLC监测至反应完成,向反应液中加入30mL水淬灭反应,用二氯甲烷(30mL×4)萃取,合并有机相,经无水硫酸钠干燥,过滤,滤液减压浓缩,残留物经柱层析纯化(乙酸乙酯/石油醚,1:2)得到黄色固体3.50g,收率77.8%,熔点212~213 ℃。HRMS (ESI) m/z:C22H20FN5O4 [M+H]+,理论值437.4256,实测值437.4216;1H NMR (400MHz,DMSO-d6)δ:11.51 (s,1H,H-7),8.70 (s,1H,H-4),7.80 (s,1H,H-9″),7.51 (dd,J=15.1、7.7 Hz,1H,H-4’),7.29~7.10 (m,3H,H-2’,H-5’,H-6’),6.89 (d,J=8.4 Hz,2H,H-2″,H-5″),6.81 (d,J=7.3 Hz,1H,H-6″),3.79 (s,3H,-OCH3),3.77 (s,3H,-OCH3),3.67~3.61 (dd,J=7.1、6.8 Hz,2H,H-8″),2.87 (t,J=7.3Hz,2H,H-7″);13C NMR (101MHz,DMSO-d6)δ:173.70,167.52,162.23,161.61,160.16,150.38,149.83,148.82,147.15,137.91,127.82,123.96,122.33,117.25,116.98,113.26,112.81,103.86,57.82,57.73,45.62,33.96。

    从目标化合物STL127705的1H NMR谱中观察到终产物存在互变异构现象,可能的互变异构位点为分子结构中的环内酰胺键,其可由酮式发生烯醇式互变(图式 3)。两种异构体之间存在一种动态平衡,在低温时这种互变速率比较慢,1H NMR可以检测出两套峰,当温度升高时,互变速率变快,就会融合成一套峰。因此测试了终产物的升温(80℃)1H NMR,图谱结果显示为一套峰,证实我们的推测。

    图式 3

    图式 3.  目标化合物的互变异构现象
    Scheme 3.  Tautomerism of target compound

    中间体4和中间体5同样存在环内酰胺键,但是在1H NMR中并未观察到明显的两套峰现象,可能是由于两种异构体稳定性差距很大,那么平衡可能99%偏向于其中一个稳定结构,1H NMR就仅会显示一套峰。然而,目标化合物的结构发生了改变,会影响平衡的偏向,两个异构体的稳定性比较接近,在室温下观测到的1H NMR就会显示出二者的氢峰,所以是两套峰。

    本文报道了一种简单、有效的DNA-PK抑制剂STL127705的合成方法。该方法以市售化工原料为起始原料,经过6步反应,以36.8%的收率得到目标产物,纯度达到95.5%。该制备方法条件温和,无需苛刻的反应条件,方法简单,技术可行性高,为新型的具有嘧啶并嘧啶二酮结构的DNA-PK抑制剂的合成研究提供了依据。

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  • 图式 1  目标化合物STL127705的逆合成路线分析

    Scheme 1  Retrosynthesis of target compound STL127705

    图式 2  本文报道的目标化合物STL127705的合成路线

    Scheme 2  Synthetic route of target compound STL127705 reported in this paper

    图式 3  目标化合物的互变异构现象

    Scheme 3  Tautomerism of target compound

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  • 发布日期:  2019-09-01
  • 收稿日期:  2019-04-18
  • 接受日期:  2019-05-17
通讯作者: 陈斌, bchen63@163.com
  • 1. 

    沈阳化工大学材料科学与工程学院 沈阳 110142

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