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基于磁纳米颗粒和分子间裂分G-四链体-血红素DNA酶的Ag+和半胱氨酸传感器研究
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关键词:
- 磁纳米颗粒
- / 分子间裂分G-四链体
- / 比色分析
- / Ag+
- / 半胱氨酸
English
Study on Biosensor for Ag+ and Cysteine Quantification Based on Magnetic Nanoparticles and Intermolecular Split G-Quardruplex-Hemin DNAzymes
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1. 引 言
银是人体的微量元素之一,离子形式的银毒性最大[1]。Ag+在水中易被生物富集,进而抑制蛋白的活性,间接影响生物的繁殖[2]。世界卫生组织规定银在饮用水中的限量为0.05 μg/mL。近年来,由于其特殊的杀菌、催化和光学特性,使银在电子、电镀、感光等行业广泛应用,这些行业的工业废水造成多地水体中的Ag+含量不断上升,对环境的污染非常严重[3]。因此,发展灵敏度高、响应快且抗干扰能力强的Ag+检测方法具有重要意义。
目前,Ag+的检测方法有很多,如原子吸收光谱法[4]、原子发射光谱[5]、电感耦合等离子体-质谱法[6, 7]、荧光检测[8]等。这些方法具有较好的特异性、准确性及灵敏性,但都需依赖大型仪器,样品前处理步骤复杂,不适合快速的现场实时检测。近年来,基于DNA检测金属离子的研究引起越来越广泛的关注,并发展了许多传感器。例如赵秋伶[9]等利用DNA中胸腺嘧啶(T)和Hg2+ 的特异性结合检测Hg2+。Zhao等[10]利用Ag+能与C形成C-Ag+-C结构的特点,发展了一种检测 Ag+的方法。1962年,美国科学家Gellert等[11]发现,一条富含鸟嘌呤(G)的 DNA 短链,在一定条件下可以由自身 4个 G 通过Hoogsteen氢键自组装成G-四分体,多个G-四分体通过π-π堆积作用进而形成 G-四链体DNA (G-quadruplex DNA),其与卟啉铁(Hemin)结合形成具有过氧化物酶催化活性的DNA酶。Hemin嵌入式G-四分体DNA酶的催化性能远比游离的Hemin强,这种新型的DNA酶制成生物传感器后,被广泛地用于生物分子和金属离子分析[12~16]。Zhou等[17]在相关研究中发现,Ag+的存在可有效阻止碱基G之间Hoogsteen氢键的形成,破坏G-四链体结构,极大地抑制G-四链体-Hemin的酶活性。该方法的建立为Ag+快速、高效检测开辟了新思路。然而,这类方法虽然优势明显,但由于传感器没有构建有效的分离体系,在复杂样品检测时容易受到干扰。
半胱氨酸(Cys)是人体非常重要的一种含巯基的氨基酸,参与蛋白质的合成、解毒和代谢等多种重要的生理功能,许多疾病的发生都与Cys缺乏有关[10, 18],如肾功能衰竭、艾滋病、老年痴呆症、帕金森病等病症。所以,Cys的定量检测一直备受关注[19~21],是临床分析、法医鉴定以及食品检验中的一项重要指标。
本探究提出了一种将磁纳米颗粒和分子间裂分G-四链体-血红素DNA酶相结合检测 Ag+和半胱氨酸的方法。与传统的DNA生物传感器分离难相比,用磁纳米颗粒为固相载体,可通过磁分离将检测探针与复杂体系中的干扰组分分离,排除了非特异性干扰,大大降低背景信号,实现了实际样品中Ag+ 和半胱氨酸的快速、灵敏、特异的比色分析。
2. 实验部分
2.1. 仪器和试剂
UV-1800型紫外-可见分光光度计(日本岛津公司);THZ-C-1台式冷冻恒温摇床(太仓市实验设备厂);Milli-Q Reference超纯水器(德国默克密理博公司);pH-2602酸度计(杭州陆恒生物科技有限公司);磁分离架(无锡百运纳米科技有限公司)。
DNA序列1(5'-GGGTAGGGCGGGAACTTTGATTTTGTTTTATCATGGACGTGCGTG TGAC-C10-Biotin 3')和DNA序列2(5'- GTCACACGCACGTCCATGATAAAA CAAAATCAAAGAAGGGT 3')由上海生工生物工程股份有限公司合成并经HPLC纯化;链霉亲和素功能化的磁纳米颗粒(MNPs,直径100 nm,德国Chemicell公司);Cys含量检测试剂盒购自北京方程佰金科技有限公司(酶标法);氯化血红素(Hemin)、2,2'-连氮基-双-(3-乙基苯并二氢噻挫啉-6-磺酸)(ABTS)、30% H2O2、二甲亚砜(DMSO)、AgNO3、Pb(NO3)2、MgCl2、FeCl3及其它金属离子均购自上海生工生物工程股份有限公司;牛血清白蛋白(BSA,上海华蓝化学科技有限公司); 所用试剂均为分析纯。
2.2. 实验过程
2.2.1. 磁纳米颗粒(MNPs)的修饰
离心管用1% BSA溶液润洗后,加入15 μL包裹链霉亲和素的磁性纳米颗粒(10 mg/mL),同时加入100 μL 柠檬酸盐缓冲液(150 mmol/L NaCl,15 mmol/L柠檬酸三钠,pH=7.0),漩涡搅拌,磁分离后弃上层液,以除去磁珠中多余的叠氮化纳。清洗3次。继续向MNPs中加入柠檬酸盐缓冲液和15 μL DNA 1(100 pmol),37℃条件下振荡反应1 h(180 r/min)。反应结束后用PBS缓冲液(pH=7.4)清洗3次。然后在4℃用100 μL 2% BSA溶液封闭1 h,以减少特异性吸附,命名为MNPs/DNA-1。将上述溶液磁分离,弃上层液后,加入60 μL Tris(10 μmol/L Tris-HAc,0.002% Triton,5 mmol/L KAc,pH=7.0)缓冲溶液和15 μL DNA 2,37℃恒温摇床振荡反应30 min形成互补的双链DNA。将溶液磁分离,弃上层液后,用PBS清洗3次除去多余的DNA 1和DNA 2 ,加入100 μL Tris-HAc缓冲溶液,于4℃下保存待用,命名为MNPs/DNA-1/DNA-2。
2.2.4. 尿液中Cys的检测
采用乙腈沉淀法去除尿液中蛋白及其它物质对检测体系的干扰。步骤如下:取1 mL尿液与1 mL乙腈混合,漩涡反应5 min,然后于20℃ 12000 r/min离心10 min,上清液于50℃真空干燥12 h,最后加入100 μL Tris-HAc缓冲溶液,待测。随后的检测流程与2.2.3节一致。
2.2.3. Cys的检测
取10 μL MNPs/DNA-1/DNA-2(1.5 mg/mL),用100 μL PBS清洗1次,再加入100 μL 150 nmol/L Ag+,37℃下反应20 min。接着加入100 μL不同浓度的Cys,37℃下反应40 min,然后加入1 μL 100 μmol/L Hemin,随后反应过程同2.2.2节。裂分式G-四链体DNA酶可催化ABTS/H2O2产生有色产物,在420nm有最大吸收,因此选择 420 nm 处的吸光度作为测量值。
2.2.2. Ag+的检测
取10 μL杂交后的磁纳米颗粒(MNPs/DNA-1/DNA-2,1.5mg/mL),用100 μL PBS清洗1次,再加入100 μL含不同浓度 Ag+ 的Tris-HAc缓冲溶液,搅拌均匀后在37℃条件下反应20 min。再加入1 μL 100 μmol/L Hemin,37℃恒温避光反应1 h。磁分离弃上层液,再用100 μL Tris-HAc洗涤1次,除去多余的Hemin和Ag+。向其中加入4 mmol/L ABTS和4 mmol/L H2O2各50 μL,在37℃条件下反应8 min,磁分离,取上层液进行紫外吸收检测。
3. 结果与讨论
3.1. 检测原理
借助分子间裂分G-四链体-血红素DNA酶的氧化还原催化特性,以磁纳米颗粒为固相载体,构建了Ag+和半胱氨酸的检测体系。此体系使用了两条寡聚核苷酸探针链(DNA 1和DNA 2),DNA 1中3'端带有生物素标记和C10延长链,通过生物素和链霉亲和素的特异性结合,将DNA固定到链霉亲和素修饰的磁纳米颗粒表面。DNA 1和DNA 2 反向互补,两者杂交形成dsDNA,从而使DNA 1的5'端和DNA 2的3'端的两段富G序列相互接近,进而折叠形成分子间裂分G-四链体[22],hemin 插入G-四链体,导致明显增强的类过氧化物酶的催化活性,能催化ABTS-H2O2反应体系并产生有色产物(图 1)。当Ag+存在时,Ag+可与鸟嘌呤碱基G结合(图 1 插图),这种结合作用有效阻止碱基G之间Hoogsteen氢键的形成,从而破坏G-四链体结构,使催化体系的酶活性显著降低。然而半胱氨酸存在时,巯基与Ag+发生强烈的相互作用,将Ag+从碱基G上竞争下来,从而促进G-四链体结构的重新形成,使G-四链体-血红素DNA酶催化体系的活性得以恢复,催化ABTS-H2O2反应体系,溶液显绿色。以磁纳米颗粒作为分离手段,极大地提高了检测体系的稳定性及提高灵敏度。
图 1
图 1 DNA酶传感器检测Ag+和半胱氨酸原理图Figure 1. Schematic diagram of fabricated DNAzyme sensor for detection of Ag+ and cysteine3.2. 传感器检测Ag+和Cys 的可行性分析
由于MNPs本身也具有一定的氧化催化性能[23],用2% BSA溶液对 MNPs/DNA-1表面做封闭处理后可避免 MNPs 本身催化的影响,还可以有效降低DNA 在磁颗粒表面的非特异吸附[13]。为验证Ag+定量检测的可行性,向MNPs/DNA-1/DNA-2中加入Hemin,其混合溶液能催化ABTS-H2O2体系,反应产物ABTS+在420 nm处有最大吸收峰,图 2 为不同组分体系传感器的紫外吸收曲线。当加入不同浓度的Ag+时,吸收值有不同程度的下降,这是由于ABTS-H2O2催化反应急剧减弱,导致反应的有色产物生成量减少。同样,在溶液中加入100 μL 100 nmol/L和40 nmol/L Cys。从图 2可见,420 nm处吸收值上升,说明Cys的巯基与Ag+发生强烈的相互作用,将Ag+从碱基G上竞争下来,促进G-四链体结构的重新形成,酶活性得以恢复。
图 2
3.3. 实验条件的优化
根据产品说明书可知,100 μL(含1 mg MNPs) MNPs可以结合150 pmol生物素化探针,本实验取出的15 μL 包裹链霉亲和素的MNPs可以结合22.5 pmol生物素化探针。考察了修饰体系中DNA 1的量为25,50,75,100,125和150 pmol时对G-四链体DNA酶催化性能的影响(不加Ag+)。结果如图 3A所示,随着修饰体系中DNA序列1的量增加,吸光值也不断增加。当修饰时DNA 1的量为100 pmol时,MNPs表面的探针固定量达到最好。ABTS和H2O2按照1:1比例发生氧化还原反应,参照文献[24],实验中ABTS和H2O2的浓度均为2 mmol/L。由于G碱基之间氢键的形成受pH值影响,本研究考察了加入Ag+后缓冲溶液pH值对检测性能的影响。从图 3B可见,当pH 7.0时,体系的A420 nm 达到最小,说明此时体系的酶活性最低。因此,本实验选取pH=7.0的Tris-HAc缓冲液。选择6个温度(20℃,25℃,30℃,35℃,40℃,45℃),对DNA酶催化反应的最适温度进行了考察。随着DNA酶催化反应温度升高,体现在反应体系ΔA420 nm增加(ΔA420 nm=A0-A1,A0,A1分别为未加Ag+前和加Ag+后的吸光度),当温度达到35℃~40℃时,ΔA420 nm达到最大,可能的原因在于当反应温度为37℃时,G-四链体DNA酶的活性最高,因此选择37℃为最适温度(图 3C )。
图 3
此外,还考察了Ag+及与Cys反应时间对检测性能的影响。从图 4A可见,DNA酶传感器与Ag+反应时间从5 min延长到20 min时,反应体系的吸光值A420 nm降低,说明随着时间的延长,Ag+ 破坏G-四链体DNA酶结构越多,催化性能降低,当反应时间达到20 min时体系的吸光值A420 nm达到最低。而传感器与Cys分别反应10~40 min时,体系的吸光值A420 nm随着反应时间的增加而增大,当反应时间到40 min时,体系吸光值达到最高 (图 4B)。所以,选择20和40 min分别作为Ag+和Cys的反应时间。
图 4
3.4. 定量检测
3.5. 方法的选择性
3.6. 实际样品的检测
分别对湘江水,湖水,自来水采样,进行Ag+的加标回收实验。水样先经0.22 μm 滤膜过滤,以除去不溶性物质,随后加入一定浓度的Ag+,用本方法对Ag+进行定量分析。由表 1 可见,自来水、湖水、湘江水的Ag+含量很低,当加入20 nmol/L Ag+,Ag+的回收率为94.5%~105.5%,相对标准偏差为1.3%~2.6%,说明此传感器能够检测河水与自来水样品中微量的Ag+。根据《国家生活饮用水卫生标准》GB 5749-2006 规定,饮用水中Ag+的限量为0.05 μg/mL,因此此DNA酶传感器可满足国家限量标准的要求。同时,采用Cys含量检测试剂盒(酶标法)检测了人尿液样本中半胱氨酸的含量,结果见表 2。3 个实际样品的测试结果和试剂盒检测值基本一致,标准偏差为3.5%~4.8%,结果令人满意。说明设计的G-四链体 DNA 酶生物传感器检测半胱氨酸的方法是可行的。
表 1
Sample Ag+ in samples (nmol/L) Added (nmol/L) Total found (nmol/L) Average recovery (%, n=5) RSD (%, n=5) 自来水 Tap water 未发现 Not found 20 18.90 94.5 2.1 湖水 Lake water 未发现 Not found 20 21.1 105.5 2.6 湘江水 Xiangjiang river 未发现 Not found 20 19.48 97.4 1.3 表 2
Sample L-cysteine in samples (nmol/L) Found (mean±SD) (nmol/L) Recovery(%, n=5) RSD(%, n=5) 1 20.50 21.0 ± 1.0 102.4 4.8 2 35.2 34.3 ± 1.2 97.5 3.5 3 52.0 54.5 ± 2.3 104.8 4.2 3.4.1. Ag+的定量检测 在优化条件下,考察了基于G-四链体DNA酶的Ag+ 传感器对不同浓度Ag+
(0~150 nmol/L)的响应。如图 5所示 ,随着Ag+浓度增大,反应体系的A420 nm不断降低。当Ag+浓度在0.5~100 nmol/L之间时,呈良好的线性关系,回归方程为A420 nm= 0.237-0.001 CAg+,线性相关系数R=0.9967。本方法的检出限为0.2 nmol/L(3σ),低于其它基于酶催化的C-Ag+-C 传感器(30 nmol/L)[17]、基于荧光标记DNA 的银离子检测法(60 nmol /L) [25]以及胶体金法(10 nmol /L) [26]等方法。
图 5
图 5 (A)Ag+浓度在0~150 nmol/L时,体系的吸收光谱图。 Ag+浓度(nmol/L): (1) 0.0 (2) 0.5 (3) 1.0 (4) 5.0 (5) 10 (6) 20 (7) 40 (8) 60 (9) 80 (10)100 (11)150 (pH=7.0),(B) 线性关系图Figure 5. (A) Absorption curves of system at Ag+ concentrations of : (1) 0.0,(2) 0.5,(3) 1.0,(4) 5.0,(5) 10,(6) 20,(7) 40,(8) 60,(9) 80,(10) 100 and (11)150 nmol/L (pH=7.0),(B) Linear calibration curve3.4.2. Cys的定量检测
在优化实验条件下,考察了传感器对不同浓度Cys的响应情况(图 6)。从图 6A可见,随着Cys浓度的增大,反应体系的A420 nm不断增加。当Cys浓度在0.1~80 nmol/L之间时,呈良好的线性关系,回归方程为A420 nm=0.121+0.002CCys,线性相关系数R=0.99427(图 6B)。以空白的3倍标准偏差除以标准曲线的斜率得到本方法的检出限为0.04 nmol/L,说明本研究的DNA酶生物传感器能够有效检测低浓度的Cys,可用于实际样品的快速检测。与其它半胱氨酸检测方法比较,如基于金纳米颗粒的半胱氨酸双信号传感器(检出限10 nmol/L[27]、检出限8.0 nmol/L[28])、基于量子点的荧光传感器(检出限3.8 nmol/L[29])、基于DNAzyme/ABTS-H2O2体系的比色传感器(50 nmol /L)[17]),本方法可以检测复杂试样体系,而且具有较高检测灵敏度。
图 6
图 6 (A)不同半胱氨酸浓度时体系吸收曲线图: (1) 0.0,(2) 0.1,(3) 1.0,(4) 5.0,(5) 10,(6) 20,(7) 40,(8) 60,(9) 80,(10)100 (pH=7.0),(B)线性关系图(CAg+: 150 nmol/L)Figure 6. (A) Absorbance curves of cys concentration from 0 to 100 nmol/L: (1) 0.0,(2) 0.1,(3) 1.0,(4) 5.0,(5) 10,(6) 20,(7) 40,(8) 60,(9) 80,and (10)100 nmol/L (pH=7.0),(B) Linear calibration curve (CAg+: 150 nmol/L)3.5.1. Ag+的选择性检测
选择了9种金属离子(Mg2+,Mn2+,Zn2+,Pb2+,Ni2+,Fe3+,Co2+,Cu2+,Cr3+),其中Ag+浓度为100 nmol/L,干扰离子的浓度均为10μmol/L,分别检验了它们对Ag+检测的干扰。如图 7所示,在无Ag+存在条件下,体系的吸光值未降低(白色柱型);向体系中同时加入Ag+和上述其它金属离子时(黑色柱型),此传感体系的吸收值和只加入Ag+的吸收值相差不多,相对标准偏差在1.6%~3.7%之间。这表明水样中存在的大量共存离子不影响传感器对Ag+的高选择性分析。
图 7
3.5.2. Cys的选择性检测
为了检验传感体系对Cys的选择性,选择了其它常见的氨基酸进行检测,其中Cys的浓度为 100 nmol/L,其它氨基酸的浓度为1 μmol/L,如图 8。在最优条件下,半胱氨酸的加入使得吸收值明显增大;而其它氨基酸单独存在时,对体系的A420 nm基本没有影响,相对标准偏差在2.6%~5.8%之间。说明用此传感器检测Cys具有很高的选择性。
图 8
4. 结 论
本研究以磁纳米颗粒和分子间裂分式G-四链体-氯化血红素DNA酶为基础发展了一种Ag+和半胱氨酸比色传感器。磁纳米颗粒的引入极大地增强了传感器的抗干扰能力,降低了背景信号,可以实现天然水体中痕量Ag+ 的快速检测以及生物复杂样本中半胱氨酸的检测,加标回收率误差在允许的范围内。本方法操作简单、灵敏度高、特异性好,适合发展为环境监测、临床分析等领域的现场实时分析技术。
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Table 1. Analytical results of Ag+ in water samples and recovery tests
Sample Ag+ in samples (nmol/L) Added (nmol/L) Total found (nmol/L) Average recovery (%, n=5) RSD (%, n=5) 自来水 Tap water 未发现 Not found 20 18.90 94.5 2.1 湖水 Lake water 未发现 Not found 20 21.1 105.5 2.6 湘江水 Xiangjiang river 未发现 Not found 20 19.48 97.4 1.3 Table 2. Analytical results of three human urine samples
Sample L-cysteine in samples (nmol/L) Found (mean±SD) (nmol/L) Recovery(%, n=5) RSD(%, n=5) 1 20.50 21.0 ± 1.0 102.4 4.8 2 35.2 34.3 ± 1.2 97.5 3.5 3 52.0 54.5 ± 2.3 104.8 4.2 -
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