人类白细胞抗原基因HLA-B*58:01基因型的快速低成本鉴别方法

初亚男 张婕妤 封利颖 周国华

引用本文: 初亚男,  张婕妤,  封利颖,  周国华. 人类白细胞抗原基因HLA-B*58:01基因型的快速低成本鉴别方法[J]. 分析化学, 2016, 44(5): 693-697. doi: 10.11895/j.issn.0253-3820.150643 shu
Citation:  CHU Ya-Nan,  ZHANG Jie-Yu,  FENG Li-Ying,  ZHOU Guo-Hua. Establishment of A Rapid and Inexpensive Identification Method for HLA-B*58:01 Genotype[J]. Chinese Journal of Analytical Chemistry, 2016, 44(5): 693-697. doi: 10.11895/j.issn.0253-3820.150643 shu

人类白细胞抗原基因HLA-B*58:01基因型的快速低成本鉴别方法

  • 基金项目:

    本文系国家自然科学基金(Nos.21275161,31300704),江苏省临床医学科技专项(No.BL2012061)南京军区南京总医院院内课题(No.2013053)资助项目

摘要: 采用焦磷酸测序技术和改进的全血基因组提取方法,建立了位于6号染色体的银屑病易感基因1候选基因1(Psoriasis susceptibility 1 candidate 1,PSORS1C1)rs9263726位点的焦磷酸测序方法,检出限达到0.4 ng/μL基因组DNA,20例标本的焦磷酸法和Sanger法测序结果完全一致。利用本方法对683例标本的rs9263726位点进行测序,得到中国人群该位点野生型(GG型)分布频率为87.6%,突变的GA型分布频率为11.7%、AA型分布频率为0.7%。通过对随机选取的46例标本rs9263726位点与人类白细胞抗原基因HLA-B*58:01基因型的连锁关系进行分析,结果表明,该位点预测HLA-B*58:01基因型的灵敏度为100%、特异性为91.3%。本方法可用于HLA-B*58:01基因型的检测。

English

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  • 收稿日期:  2015-08-13
  • 修回日期:  2016-01-12
通讯作者: 陈斌, bchen63@163.com
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    沈阳化工大学材料科学与工程学院 沈阳 110142

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