Target Identification of Bioactive Natural Products
- Corresponding author: Xiao Youli, ylxiao@sibs.ac.cn
Citation:
Zhou Yiqing, Xiao Youli. Target Identification of Bioactive Natural Products[J]. Acta Chimica Sinica,
;2018, 76(3): 177-189.
doi:
10.6023/A17110484
氢能是一种清洁可持续、无污染、热值高、分布广泛的新能源,有望替代传统的化石燃料。但是,目前氢能主要来源于化石能源,在生产过程中依然会产生碳排放,对环境造成污染。同时,在运输和储存氢气的过程中也存在严重的安全问题。氨硼烷是一种可以快速释放大量氢气并且不含碳的储氢材料,其理论含氢量高达19.6%。采用先进催化技术从氨硼烷溶液中获得高纯氢有望提供一种氢气制、储、运、用一体化新模式,实现“按需在线制氢和用氢”,巧妙解决氢气储运成本高、用氢安全方面等问题。然而,氨硼烷水溶液在常温下化学性质稳定,不易发生水解反应。举例而言,1 mol·L-1的氨硼烷在25 ℃惰性气体中可以稳定保存80 d[1]。因此,亟需开发新型催化剂加速氨硼烷在室温下的水解制氢反应。
目前,研究人员主要利用铂[2]、钌[3]、钯、铑[4]等贵金属作为氨硼烷水解的高效催化剂,但同时人们也发现钴、镍等非贵金属粒子对氨硼烷水解也具有良好的催化活性[5]。Kang等[6]使用模板法制备了无定形Co⁃Ni⁃B非晶多孔球,其中Ni10.0Co74.5B15.5性能最佳,催化氨硼烷的转换频率(TOF)为6.5 min-1。Yang等[7]将无定形CuCo合金纳米粒子负载在氮化硼纳米纤维上,得益于Cu与Co之间的协同作用,Cu0.4Co0.6/BNNF的催化氨硼烷水解产氢速率高达3 387.1 mL·min-1·g-1。然而,无定形金属和负载型催化剂在多次循环后会发生形貌坍塌或金属活性位点脱落的现象,导致催化性能急剧下降。相比于无定形催化剂,晶态的过渡金属硼化物由于其表面存在稳定的电子结构、耐酸耐碱的化学性质以及类贵金属的催化性能,在催化氨硼烷水解产氢方面有着广泛的应用前景,但苛刻的制备条件极大地限制了其实际应用。
我们采用一步锡热法制备了硼化钴(CoB)等过渡金属硼化物,并测试其催化氨硼烷室温水解性能。其在室温条件下的TOF值为35.3 molH2·molcat-1· min-1,优于同等条件下贵金属Pt催化剂(TOF=29.3 molH2·molcat-1·min-1),重复循环测试8次后依然保持稳定的催化性能。利用X射线衍射(XRD)、X射线光电子能谱(XPS)、透射电子显微镜(TEM)、电子顺磁共振(EPR)等测试手段研究了催化剂的形貌结构并进一步对催化机理进行了探索。研究发现CoB表面被氨硼烷还原的Co0是催化制氢反应的活性位点[8],而以B2O3和B0形式存在的表面B物种能够有效辅助Co0位点催化氨硼烷产氢[9]。
氨硼烷、二氯化钴、二氯化镍、三氯化铁、五氯化钼、三氯化铬、五氯化钒、二氯化锰、二氧化钛、二氧化锆、硼化钨、无定形硼粉、锡粉、氯化钠、氯化钾,均购自阿拉丁试剂有限公司,纯度为分析纯。溶剂为去离子水。
采用锡热法制备CoB催化剂。称取1 mmol CoCl2、1.5 mmol Sn、6 mmol无定形硼粉。其中CoCl2作为钴源,无定形硼粉作为硼源和还原剂,Sn作为助还原剂以及反应溶剂。三者充分研磨,将研磨后的样品放入管式炉内煅烧,氢氩气(5% H2)氛围,升温速率为5 ℃·min-1,800 ℃保温8 h。随后用1 mol· L-1 HCl溶液洗涤多余的Sn以及B2O3,再使用去离子水多次清洗,直至洗涤液pH=7,将所得固体烘干研磨备用,即为纳米CoB晶体。使用相同的方法制备了NiB和FeB。
采用高温熔盐法制备CrB2、MoB2、VB2、MnB4。称取物质的量之比为1∶8的过渡金属氯化物(1 mmol)和硼氢化钠(8 mmol),加入0.5 g熔盐(NaCl、KCl物质的量之比1∶1),将三者充分研磨,将研磨后的样品放入管式炉内煅烧,氢氩气(5% H2)氛围,升温速率为5 ℃·min-1,800 ℃保温8 h。随后用去离子水将多余的熔盐洗去。将所得固体烘干备用。
同样采用高温熔盐法制备TiB2、ZrB2。称取并混合物质的量之比为1∶5的过渡金属氧化物(1 mmol)和硼粉(5 mmol),加入0.5 g熔盐,将三者充分研磨,将研磨后的样品放入管式炉内煅烧,氮气氛围,升温速率为5 ℃·min-1,1 000 ℃保温2 h,制备得到TiB2、ZrB2。文中若无特别指出,则除TiB2、ZrB2合成温度为1 000 ℃以外,其余硼化物合成温度均为800 ℃。
XRD图采用Bruker D8型X射线衍射仪测试,辐射源为Cu Kα,波长为0.154 nm,工作电压30 kV,工作电流30 mA,扫描范围为15°~80°,扫描速度为5 (°)·min-1。TEM图采用FEI Tecnai G2 F20型透射电子显微镜,点分辨率0.23 nm,线分辨率0.14 nm,最大加速电压200 kV。SEM图采用蔡司Sigma 300型扫描电子显微镜测试,能谱仪型号为Smart EDX,分辨率1.0 nm,最大加速电压30 kV。XPS谱图采用Thermo Scientific K⁃Alpha+型X射线光电子能谱仪测试,X射线源为单色化Al Kα源(1 486.6 eV),其结合能参考表面无定型碳C1s在284.8 eV处的峰,以修正电荷效应引起的位移。采用Bruker EPR A⁃300电子顺磁共振光谱仪检测氨硼烷溶液水解反应过程中产生的自由基。以5,5⁃二甲基⁃1⁃吡咯啉⁃N⁃氧化物(DMPO)作自由基捕获剂,测试参数:中心场设置为3 507 G,扫描宽度为100 G,微波桥微波频率为9.86 GHz,功率为20 mW,信号通道调制频率为100 kHz,转换时间为20 ms,测试温度为室温25 ℃。
催化水解氨硼烷溶液制氢的反应容器是55 mL的石英管。称量并加入5.0 mg催化剂粉末,随后加入5 mL反应溶液,使用硅胶密封塞密封以确保反应容器的气密性,将石英管置于25 ℃恒温水浴搅拌器内反应。为确保测试精确性,使用10 mmol·L-1的低浓度氨硼烷溶液进行测试,每隔1 min使用气体微量进样器抽取400 µL气体,并使用GC⁃TCD气相色谱仪检测H2的含量。
循环测试:将首次反应后的液体进行离心,使用强磁铁吸引固定CoB,同时去除离心上清液,固体催化剂用去离子水洗涤后即可进行第2次实验,反应条件与第1次相同,如此进行多次重复实验。
通过XRD研究了不同温度合成的CoB的晶相结构,结果如图 1a所示,由图可知,800 ℃下制备的CoB的衍射峰都与单斜晶相的CoB(PDF No.65⁃2596) 对应,未观察到杂质,说明合成了较为纯的CoB晶体。其中,在41.15°处出现的峰为(111)主晶面,CoB晶体空间群为Pnma,通过计算得知晶胞参数a= 0.525 4 nm,b=0.304 3 nm,c=0.395 6 nm。通过Scherrer公式计算得知CoB的平均晶粒尺寸为39.9 nm。并且伴随着合成温度的下降,CoB的结晶性也越来越差。SEM图显示样品为片状CoB组成的网络结构(图 1b)。线性扫描显示CoB表面仅存在Co和B元素(图 1b插图)。图 1c和1d是CoB的TEM图及其晶格解析图,晶格间距0.199和0.219 nm分别对应CoB的(111)和(210)晶面。从选区电子衍射图(图 1e)中观察到分别属于(111)、(202)和(102)晶面的衍射斑,这也证实了CoB纳米粒子的成功合成。
CoB与其他硼化物催化氨硼烷溶液水解制氢的性能如图 2所示,在各类硼化物中,CoB的性能优于同样具备正交结构的NiB和FeB,其中CoB在5 min内的H2、NH3BH3物质的量之比(nH2/nNH3 BH3)为3,表明氨硼烷已完全反应,而NiB在7 min才到达反应终点;TiB2等具有二维结构的MBx型硼化物即使在30 min仍然未到反应终点,说明其它MBx对氨硼烷溶液的催化活性较差。
对不同煅烧温度合成的CoB进行催化性能测试发现,随着合成温度的下降,CoB的结晶度下降,催化活性却有所提升。这是因为无定形的CoB表面能够暴露出更多的活性位点Co0。催化剂稳定性是重要的性能评价指标之一,我们对不同的催化材料进行了循环实验。图 3b表明400 ℃下合成的CoB在循环过程中存在明显的反应速率衰减问题,在经历8次循环后只保留了初始性能的74.0%。图 3b~3e为500~700 ℃制备的CoB的循环曲线,其经过8次循环后仍能在5 min内到达反应终点,但是反应过程中性能却在下降(如图 3c~3e中黑线所示的反应速率的变化趋势)。图 3f为800 ℃煅烧合成的CoB,在8次循环后仍具有良好的活性,并且在反应过程中也未出现活性下降的情况。以上结果证明结晶程度是影响催化剂稳定性的重要因素。后文中所用的CoB均为800 ℃煅烧所得。
根据文献报道,碱性介质的引入可以加速氨硼烷水解,从而加速产氢速率[10]。通过调节溶液中NaOH的浓度发现,随着碱浓度的增加,催化速率不断提高。其稳定产氢时的斜率可以反映催化速率,从不加NaOH(红色曲线) 的斜率(0.84) 到引入0.1 mol·L-1 NaOH(黑色曲线)的斜率(1.48)可知,催化速率在引入NaOH后提升0.8倍。同时观察到不加NaOH的反应在0~1 min时出现了平台期,而引入NaOH后平台逐渐消失。以上结果说明碱性介质的引入不仅能够提高催化反应的速率,而且能使反应提前发生,据此推测氢氧根离子(OH-)在反应中扮演着重要的角色。当NH3BH3与NaOH的物质的量浓度之比调节至1∶3时(图中绿色曲线),反应在4 min已达到终点,而继续升高该比例至1∶10,反应终点没有继续提前,这一结果表明当OH-的浓度高于NH3BH3的3倍时即为过量。
催化剂表面元素的电子状态对催化效果有着重要的影响,通过XPS研究CoB催化剂表面的化学性质。从CoB的XPS全谱图观察到催化剂表面由Co、B、O三种元素构成(图 5a)。图 5b为催化反应前后的Co2p谱图,观察到的2个自旋轨道峰分别对应Co2p3/2和Co2p1/2轨道并且伴随卫星峰,其中反应前在780.7和796.7 eV处出现的峰对应Co2+的特征峰。相比之下,催化反应后Co2p谱图中Co0的含量(红线指出)有显著的增加,这是由于氨硼烷具有微弱的还原性,将表面的Co2+部分还原成了Co0[8]。Co0与Ni0对氨硼烷水解有催化作用[5],而其他零价过渡金属对氨硼烷溶液鲜有催化作用。综上所述,推理出在催化体系中产生的Co0是催化氨硼烷水解反应的活性位点。
为了验证Co0为活性位点这一推断,对CoB表面进行了氧化和还原处理。首先将一部分CoB在还原气氛下煅烧,还原CoB表面以生成Co0。再将另外一部分CoB在过氧化氢溶液中浸泡,消除表面存在的Co0。图 6a表明表面被还原的CoB发生催化反应的时间早于表面被氧化的CoB,这归因于经过氧化处理的CoB在催化时需要首先经历Co的氧化态被还原成为Co0的过程,而经过还原处理的CoB表面本身就含有Co0位点。在反应中期二者的反应速率相当,最终二者均能达到反应终点并产生氢气。这说明Co0为活性位点。
为了进一步研究CoB的催化原理,探寻硼在催化剂中扮演的角色,对不含硼的钴基材料进行氨硼烷溶液催化测试。从图 6b观察到氧化钴(Co3+)对氨硼烷溶液没有催化活性,氧化亚钴(Co2+)催化活性略优于Co3+,而纳米钴粉是三者中催化活性最好的,这说明催化活性主要来源是Co0。当将纳米钴粉与硼粉按物质的量之比1∶1机械研磨后发现活性有较高的提升,这主要归功于B的引入使Co分散更好,减少了Co的团聚现象,提高了催化剂与溶液的接触面积,从而提高了催化活性。CoB催化活性优于二者的简单混合,说明除了分散Co0,在CoB中的B还起到其他重要作用。进一步分析B1s XPS谱图(图 5c)可知,192.6 eV处对应B3+的特征峰,归因于表面存在B2O3。188.4 eV处对应B0的特征峰,与B的标准特征峰(187.2 eV)相比,B0的峰位置向高结合能方向移动,即发生了B物种的电子向Co物种转移的现象。因此,CoB表面的Co位点附近会形成电子富集,这不仅使得表面的Co2+易被还原剂还原到Co0,同时使Co位点获得了捕捉硼烷基底物的能力。与其他化合物相比较,B为金属元素提供电子是硼化物独具的特点[9]。综上,B与Co的协同作用体现在电子从B物种向Co物种的传递,起到了活化表面Co物种的作用。
利用EPR,使用DMPO作为自由基捕获剂,测试了反应过程中产生的自由基,探寻反应过程。图 6c中显示的9重峰为氢自由基(·H)的特征峰,并且随着时间的增加·H信号在不断增强,表明反应过程中不断有·H产生。已有实验证明氨硼烷水解的·H一部分来源于水中的H,一部分来源于氨硼烷中与B相连的H[10],二者发生归中反应形成H2。由于反应中并没有观测到羟基自由基的存在,结合前文碱性介质的引入能增加反应速率以及Co位点发生电子富集的结论,可推测水并没有解离产生羟基自由基而是在Co位点处得电子产生了氢氧根离子(H2O+ e- → ·H+OH-)。
综上所述,催化氨硼烷水解制氢的化学步骤如下:第1步,溶液中具有弱还原性的NH3BH3将CoB表面的Co2+部分还原成Co0;第2步,溶液中的NH3BH3和H2O吸附于CoB表面的Co位点上;第3步,水被富电子的Co0活化,得电子发生H2O+e- → OH-+·H反应,在无碱的条件下该基元反应为催化反应的决速步骤[11]。同时Co0作为活性位点,打断键能较低的B—N键,形成硼活性中间体Co⁃BH3,中间体被水活化的OH-进攻,生成BO2-和·H,而Co原子与·H的结合能较弱,形成的·H迅速从Co表面脱落[11],与水分解产生的·H结合形成H2逸出[12]。反应方程式如下:
|
催化剂的用量对催化速率的影响如图 7a所示,在25 ℃及10 mmol氨硼烷溶液中,nH2/nNH3BH3=3为固定值,表明可以完全析氢。在2.5~10 mg催化剂的用量范围内,用量越高析氢速率(RH2)越快,如图 7b所示。以析氢速率的对数与催化剂用量(m)的的对数作图可得拟合曲线的斜率为0.98,说明氨硼烷水解反应对于催化剂用量是一级反应。图 7c表明随着反应的发生氨硼烷溶液浓度逐渐下降,但是反应速率没有明显下降,说明该反应对于氨硼烷浓度是零级反应。在实际应用中可以通过改变催化剂的量从而达到快速调整反应速率的目的。
基于产氢速率,进一步计算催化反应的TOF,公式为TOF=nH2/(ncatt)。其中nH2、ncat表示在t时产生氢气的物质的量以及CoB催化剂活性位点的物质的量。反应温度为25 ℃,氨硼烷初始浓度为0.01 mol· L-1。图 7a中计算得到2.5 mg催化剂(红色曲线)斜率为0.302,5 mg催化剂(橙色曲线)斜率为0.598,催化剂的用量与产氢速率均为2倍关系,说明在该实验条件下催化剂用量在5 mg以内时活性位点完全被利用,以此计算TOF较为准确。通过Co2p轨道的XPS计算Co0约占所有价态Co的1.82%。以此为活性位点计算,在反应平稳的2~4 min下计算得到TOF=35.3 molH2·molcat-1·min-1。如表 1所示,CoB的TOF数值高于其他非贵金属催化剂催化氨硼烷溶液产氢的数值,证明相较于同类型催化剂,CoB催化效率更高。在相同条件下贵金属Pt负载碳催化剂(含Pt量为10%)在30~90 s内产氢量为75.8 µmol,以此数据计算可得TOF=29.3 molH2·molcat-1·min-1。CoB的催化活性略优于贵金属催化剂,并且更加经济,分布更加广泛,是一种可以替代贵金属的催化剂。
Catalyst | TOF / (molH2·molcat-1·min-1) | Ea / (kJ·mol-1) | Reusability / % | Ref. |
CoB | 35.3 | 23 | 100%(8 cycles) | This work |
Co⁃W⁃B⁃P/Ni | — | 29 | 92%(10 cycles) | [13] |
Co⁃P hollow | 23.5 | 38.7 | 90%(7 cycles) | [14] |
Co⁃B hollow | 23 | 47 | 100%(7 cycles) | [15] |
CoNi/rGO | 20 | 40 | 70%5 (cycles) | [16] |
Co/graphene | 13.9 | 32.75 | 100%(5 cycles) | [17] |
Co⁃Ni⁃B | 6.5 | 38.62 | 100%(4 cycles) | [6] |
活化能(Ea)是评价催化效果的重要指标。我们研究了不同温度下氨硼烷溶液的析氢速率,如图 7c、7d所示,从Arrhenius斜率可知,CoB催化氨硼烷溶液析氢的Ea=23.00 kJ·mol-1。相对较低的活化能证明在室温下该反应容易发生。
为研究CoB对于硼烷基化合物的水解是否具有普遍的催化活性,对一系列硼化物对甲硼烷叔丁胺配合物、二甲氨硼烷等含有硼烷的基团化合物进行了测试。如图 8所示,与催化氨硼烷的规律相同,对于这2类含有硼烷基的化合物,CoB均表现出最佳的催化效果,NiB次之,而其余硼化物则没有表现出催化性能。因此催化反应式可以概括如下:
|
通过锡热法合成了晶态的CoB,并测试其在氨硼烷溶液中催化水解制氢的性能。其中CoB在各类金属硼化物中表现出最佳性能,其TOF高达35.3 molH2·molcat-1·min-1,优于相同反应条件下的Pt催化剂。研究发现CoB催化活性主要来源于CoB表面的被还原的Co0位点,而B位点同时起到2个作用:(1) 提供电子协助Co2+被还原成Co0形成活性位点;(2) 在Co附近形成的电子聚集使其可以有效地捕捉溶液中的硼烷基团,从而促进反应的快速发生。基于此机理深入研究发现,CoB对于硼烷类化合物的水解具有普遍催化活性。本工作为过渡金属硼化物晶体在能源催化领域的应用提供了新的思路。
Koehn, F. E.; Carter, G. T. Nat. Rev. Drug Discov. 2005, 4, 206.
doi: 10.1038/nrd1657
Calson, E. E. ACS Chem. Biol. 2010, 5, 639.
doi: 10.1021/cb100105c
Gao, Y.; Hu, J.; Ju, Y. Acta Chim. Sinica 2016, 74, 312(in Chinese).
Rodrigues, T.; Reker, D.; Schneider, P.; Schneider, G. Nat. Chem. 2016, 8, 531.
doi: 10.1038/nchem.2479
Xu, Y.; Cheng, J. Chinese Sci. Bull. 2017, 62, 908(in Chinese).
Schenone, M.; Dancik, V.; Wagner, B. K.; Clemons, P. A. Nat. Chem. Biol. 2013, 9, 232.
doi: 10.1038/nchembio.1199
Titov, D. V.; Liu, J. O. Bioorgan. Med. Chem. 2012, 20, 1902.
doi: 10.1016/j.bmc.2011.11.070
Rix, U.; Superti-Furga, G. Nat. Chem. Biol. 2009, 5, 616.
doi: 10.1038/nchembio.216
Geoghegan, K. F.; Johnson, D. S. Annu. Rep. Med. Chem. 2010, 45, 345.
doi: 10.1016/S0065-7743(10)45021-6
Kawatani, M.; Osada, H. MedChemComm 2014, 5, 277.
doi: 10.1039/c3md00276d
Wang, C.; Chen, N. Acta Chim. Sinica 2015, 73, 657(in Chinese).
Harding, M. W.; Galat, A.; Uehling, D. E.; Schreiber, S. L. Nature 1989, 341, 758.
doi: 10.1038/341758a0
Taunton, J.; Hassig, C. A.; Schreiber, S. L. Science 1996, 272, 408.
doi: 10.1126/science.272.5260.408
Sin, N.; Meng, L.; Wang, M. Q.; Wen, J. J.; Bornmann, W. G.; Crews, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1997, 94, 6099.
doi: 10.1073/pnas.94.12.6099
Griffith, E. C.; Su, Z.; Turk, B. E.; Chen, S.; Chang, Y. H.; Wu, Z.; Biemann, K.; Liu, J. O. Chem. Biol. 1997, 4, 461.
doi: 10.1016/S1074-5521(97)90198-8
Griffith, E. C.; Su, Z.; Niwayama, S.; Ramsay, C. A.; Chang, Y.; Liu, J. O. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1998, 95, 15183.
doi: 10.1073/pnas.95.26.15183
Kudo, N.; Matsumori, N.; Taoka, H.; Fujiwara, D.; Scheriner, E. P.; Wolff, B.; Yoshida, M.; Horinouchi, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999, 96, 9112.
doi: 10.1073/pnas.96.16.9112
Low, W. K.; Dang, Y.; Schneider-Poetsch, T.; Shi, Z.; Choi, N. S.; Rzasa, R. M.; Shea, H. A.; Li, S.; Park, K.; Ma, G.; Romo, D.; Liu, J. O. Method. Enzymol. 2007, 431, 303.
doi: 10.1016/S0076-6879(07)31014-8
Yamaoka, M.; Sato, K.; Kobayashi, M.; Nishio, N.; Ohkubo, M.; Fujii, T.; Nakajima, H. J. Antibiot. 2005, 58, 654.
doi: 10.1038/ja.2005.90
Bargagna-Mohan, P.; Hamza, A.; Kim, Y. E.; Ho, Y. K. A.; Mor-Vaknin, N.; Wendschlag, N.; Liu, J.; Evans, R. M.; Mar-kovitz, D. M.; Zhan, C.; Kim, K. B.; Mohan, R. Chem. Biol. 2007, 14, 623.
doi: 10.1016/j.chembiol.2007.04.010
Ki, S. W.; Ishigami, K.; Kitahara, T.; Kasahara, K.; Yoshida, M.; Horinouchi, S. J. Biol. Chem. 2000, 275, 39231.
doi: 10.1074/jbc.M006192200
Dong, T.; Li, C.; Wang, X.; Dian, L.; Zhang, X.; Li, L.; Chen, S.; Cao, R.; Li, L.; Huang, N.; He, S.; Lei, X. Nat. Commun. 2015, 6, 6522.
doi: 10.1038/ncomms7522
Margarucci, L.; Monti, M. C.; Cassiano, C.; Mozzicafreddo, M.; Angeletti, M.; Riccio, R.; Tosco, A.; Casapullo, A. Chem. Commun. 2013, 49, 5844.
doi: 10.1039/c3cc41858h
Cassiano, C.; Margarucci, L.; Exposito, R.; Riccio, R.; Tosco, A.; Casapullo, A.; Monti, M. C. Chem. Commun. 2014, 50, 6043.
doi: 10.1039/C4CC00989D
Klaić, L.; Morimoto, R. I.; Silverman, R. B. ACS Chem. Biol. 2012, 7, 928.
doi: 10.1021/cb200539u
Li, J.; Casteels, T.; Frogne, T.; Ingvorsen, C.; Honore, C.; Courtney, M.; Huber, K. V. M.; Schminer, N.; Kimmel, R. A.; Ramanov, R. A.; Sturtzel, C.; Lardeau, C.; Klughammer, J.; Farlik, M.; Sdelci, S.; Vieira, A.; Avolio, F.; Briand, F.; Baburin, I.; Majek, P.; Pauler, F. M.; Penz, T.; Stukalov, A.; Gridling, M.; Parapatics, K.; Barbieux, C.; Berishvili, E.; Spittler, A.; Colinge, J.; Bennett, K.; Hering, S.; Sulpice, T.; Bock, C.; Distel, M.; Harkany, T.; Meyer, D.; Superti-Furga, G.; Collombat, R.; Hechsher-Sorensen, J.; Kubicek, S. Cell 2017, 168, 86.
doi: 10.1016/j.cell.2016.11.010
Kong, L. M.; Deng, X.; Zuo, Z. L.; Sun, H. D.; Zhao, Q. S.; Li, Y. Oncotarget 2014, 5, 11354.
Liu, C.; Yin, Q.; Zhou, H.; Wu, Y.; Pu, J.; Xia, L.; Liu, W.; Huang, X.; Jiang, T.; Wu, M.; He, L.; Zhao, Y.; Wang, X.; Xiao, W.; Chen, H.; Zhao, Q.; Zhou, A.; Wang, L.; Sun, H.; Chen, G. Nat. Chem. Biol. 2012, 8, 486.
doi: 10.1038/nchembio.935
Zhao, Q.; Ding, Y.; Deng, Z.; Lee, O. Y.; Gao, P.; Chen, P.; Rose, R. J.; Zhao, H.; Zhang, Z.; Tao, X.; Heck, A. J. R.; Kao, R.; Yang, D. Chem. Sci. 2015, 6, 4124.
doi: 10.1039/C5SC00633C
Li, D.; Li, C.; Li, L.; Chen, S.; Wang, L.; Li, Q.; Wang, X.; Lei, X.; Shen, Z. Cell Chem. Biol. 2016, 23, 257.
doi: 10.1016/j.chembiol.2015.08.018
Yi, C. M.; Yu, J.; Kim, H.; Lee, N. R.; Kim, S. W.; Lee, N. J.; Lee, J.; Seong, J.; Kim, N. J.; Inn, K. S. Chem. Commun. 2017, 53, 7045.
doi: 10.1039/C7CC02789C
Capolupo, A.; Esposito, R.; Zampella, A.; Festa, C.; Roccio, R.; Casapullo, A.; Tosco, A., Monti, M. C. J. Nat. Prod. 2017, 80, 909.
doi: 10.1021/acs.jnatprod.6b00793
Kanoh, N.; Kumashiro, S.; Simizu, S.; Kondoh, Y.; Hatakeyama, S.; Tashiro, H.; Osada, H. Angew. Chem. Int. Ed. 2003, 115, 5742.
doi: 10.1002/(ISSN)1521-3757
Kanoh, N.; Honda, K.; Simizu, S.; Muroi, M.; Osada, H. Angew. Chem. Int. Ed. 2005, 44, 3559.
doi: 10.1002/(ISSN)1521-3773
Hirohama, M.; Kumar, A.; Fukuda, I.; Matsuoka, S.; Igarashi, Y.; Saitoh, H.; Takagi, M.; Shinya, K.; Honda, K.; Kondoh, Y.; Saito, T.; Nakao, Y.; Osada, H.; Zhang, K. Y. J.; Yoshida, M.; Ito, A. ACS Chem. Biol. 2013, 8, 2635.
doi: 10.1021/cb400630z
Kolb, H. C.; Finn, M. G.; Sharpless, K. B. Angew. Chem. Int. Ed. 2001, 40, 2004.
doi: 10.1002/(ISSN)1521-3773
Kalesh, K. A.; Clulow, J. A.; Tate, E. W. Chem. Commun. 2015, 51, 5497.
doi: 10.1039/C4CC09527H
Ciepla, P.; Konitsiotis, A. D.; Serwa, R. A.; Masumoto, N.; Leong, W. P.; Dallman, M. J.; Magee, A. I.; Tate, E. W. Chem. Sci. 2014, 5, 4249.
doi: 10.1039/C4SC01600A
Kreuzer, J.; Bach, N. C.; Forler, D.; Sieber, S. A. Chem. Sci. 2015, 6, 237.
doi: 10.1039/C4SC02339K
Batternberg, O. A.; Yang, Y.; Verhelst, S. H. L.; Sieber, S. A. Mol. BioSyst. 2013, 9, 343.
doi: 10.1039/c2mb25446h
Wang, J.; Zhang, J.; Zhang, C.; Wong, Y. K.; Lim, T. K.; Hua, Z.; Liu, B.; Tannenbaum, S. R.; Shen, H.-M.; Lin, Q. Sci. Rep. 2016, 6, 22146.
doi: 10.1038/srep22146
Wang, J.; Tan, X. F.; Nguyen, V. S.; Yang, P.; Zhou, J.; Gao, M.; Li, Z.; Lim, T. K.; He, Y.; Ong, C. S.; Lay, Y.; Zhang, J.; Zhu, G.; Lai, S.-L.; Ghosh, D.; Mok, Y. K.; Shen, H.-M.; Lin, Q. Mol. Cell. Proteomics 2014, 13, M113. 029793.
Wang, J.; Zhang, C.; Chia, W.; Loh, C.; Li, Z.; Lee, Y.; He, Y.; Yuan, L.; Lim, T.; Liu, M.; Liew, C.; Lee, Y.; Zhang, J.; Lu, N.; Lim, C.; Hua, Z.; Liu, B.; Shen, H.-M.; Tan, S.; Lin, Q. Nat. Commun. 2015, 6, 10111.
doi: 10.1038/ncomms10111
Ismail, H. M.; Barton, V.; Phanchana, M.; Charoensutthivarakul, S.; Wong, M. H. L.; Hemingway, J.; Biagini, G. A.; O'Neill, P. M.; Ward, S. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2016, 113, 2080.
doi: 10.1073/pnas.1600459113
Zhou, Y.; Li, W.; Xiao, Y. ACS Chem. Biol. 2016, 11, 882.
doi: 10.1021/acschembio.5b01043
Zhou, Y.; Li, W.; Zhang, X.; Zhang, H.; Xiao, Y. Chem. Commun. 2016, 52, 14035.
doi: 10.1039/C6CC07581A
Li, J.; Cisar, J. S.; Zhou, C.-Y.; Vera, B.; Williams, H.; Rodrigurz, A. D.; Cravatt, B. F.; Romo, D. Nat. Chem. 2013, 5, 510.
doi: 10.1038/nchem.1653
Nishino, M.; Choy, J. W.; Gushwa, N. N.; Oses-Prieto, J. A.; Koupparis, K.; Burlingame, A. L.; Renslo, A. R.; McKerrow, J. H.; Taunton, J. eLife 2013, 2, e00712.
Zheng, B.; Zhu, S.; Wu, X. ACS Chem. Biol. 2015, 10, 115.
doi: 10.1021/cb500758s
Yang, J.; Tallman, K. A.; Porter, N. A.; Liebler, D. C. Anal. Chem. 2015, 87, 2535.
doi: 10.1021/ac504685y
Wright, M. H.; Tao, Y.; Drechsel, J.; Krysiak, J.; Chamni, S.; Weigert-Munoz, A.; Harvey, N. L.; Romo, D.; Sieber, S. A. Chem. Commun. 2017, DOI:10. 1039/C7CC04990K.
doi: 10.1039/C7CC04990K
Yang, M.; Chen, P. Acta Chim. Sinica 2015, 73, 783.
doi: 10.3866/PKU.WHXB201502062
Smith, E.; Collins, I. Future Med. Chem. 2015, 7, 159.
doi: 10.4155/fmc.14.152
Park, J.; Koh, M.; Koo, J. Y.; Lee, S.; Park, S. B. ACS Chem. Biol. 2015, 11, 44.
Kleiner, P.; Heydenreuter, W.; Stahl, M.; Korotkov, V. S.; Sieber, S. A. Angew. Chem. Int. Ed. 2017, 56, 1396.
doi: 10.1002/anie.201605993
Lamos, S. M.; Krusemark, C. J.; McGee, C. J.; Scalf, M.; Smith, L. M.; Belshaw, P. J. Angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 4329.
doi: 10.1002/(ISSN)1521-3773
Eirich, J.; Orth, R; Sieber, S. A. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 12144.
doi: 10.1021/ja2039979
Shi, H.; Cheng, X.; Sze, S. K.; Yao, S. Q. Chem. Commun. 2011, 47, 11306.
doi: 10.1039/c1cc14824a
Hulce, J. J.; Cognetta, A. B.; Niphakis, M.; Tull, S. E.; Cravatt, B. F. Nat. Methods 2012, 10, 259
Zhuang, S.; Li, Q.; Cai, L.; Wang, C.; Lei, X. ACS. Cent. Sci. 2017, 3, 501.
doi: 10.1021/acscentsci.7b00134
Konziase, B. Anal. Biochem. 2015, 482, 25.
doi: 10.1016/j.ab.2015.04.020
Guo, H.; Xu, J.; Hao, P.; Ding, K.; Li, Z. Chem. Commun. 2017, 53, 9620.
doi: 10.1039/C7CC04190J
Lehmann, J.; Richers, J.; Pothig, A.; Sieber, S. A. Chem. Commun. 2017, 53, 107.
doi: 10.1039/C6CC08365J
Wang, D.; Cao, Y.; Zheng, L.; Lv, D.; Chen, L.; Xing, X.; Zhu, Z.; Li, X.; Chai, Y. Chem. Commun. 2017, 53, 5020.
doi: 10.1039/C7CC02227A
Zhou, Y.; Di, Z.; Li, X.; Shan, Y.; Li, W.; Zhang, H.; Xiao, Y. Chem. Commun. 2017, 53, 8671.
doi: 10.1039/C7CC04345G
Wright, M. H.; Fetzer, C.; Sieber, S. A. J. Am. Chem. Soc. 2017, 139, 6152.
doi: 10.1021/jacs.7b01072
Tamura, T.; Tsukiji, S.; Hamachi, I. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 2216.
doi: 10.1021/ja209641t
Hughes, C. C.; Yang, Y.; Liu, W.; Dorrestein, P. C.; La Clair, J. J.; Fenical, W. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 12094.
doi: 10.1021/ja903149u
Li, G.; Liu, Y.; Liu, Y.; Chen, L.; Wu, S.; Liu, Y.; Li, X. Angew. Chem. Int. Ed. 2013, 52, 9544.
doi: 10.1002/anie.v52.36
Park, J.; Oh, S.; Park, S. B. Angew. Chem. Int. Ed. 2012, 51, 5447.
doi: 10.1002/anie.201200609
Leriche, G.; Chisholm, L.; Wagner, A. Bioorg. Med. Chem. 2012, 20, 571.
doi: 10.1016/j.bmc.2011.07.048
Li, W.; Zhou, Y.; Tang, G.; Xiao, Y. Bioconjugate Chem. 2016, 27, 2828.
doi: 10.1021/acs.bioconjchem.6b00556
Barglow, K. T.; Cravatt, B. F. Nat. Methods 2007, 4, 822.
doi: 10.1038/nmeth1092
Abegg, D.; Frei, R.; Cerato, L.; Prasad Hari, D.; Wang, C.; Waser, J.; Adibekian, A. Angew. Chem. Int. Ed. 2015, 54, 10852.
doi: 10.1002/anie.201505641
Wang, C.; Weerapana, E.; Blewett, M. M.; Cravatt, B. F. Nat. Methods 2014, 11, 79.
doi: 10.1038/nmeth.2759
Zhou, Y.; Li, W.; Wang, M.; Zhang, X.; Zhang, H.; Tong, X.; Xiao, Y. Mol. BioSyst. 2017, 13, 83.
doi: 10.1039/C6MB00691D
Grossman, E. A.; Ward, C. C.; Spradlin, J. N.; Bateman, L. A.; Huffman, T. R.; Miyamoto, D. K.; Kleinman, J. I.; Nomura, D. K. Cell Chem. Biol. 2017, 24, 1368.
doi: 10.1016/j.chembiol.2017.08.013
Tian, C.; Sun, R.; Liu, K.; Fu, L.; Liu, X.; Zhou, W.; Yang, Y.; Yang, J. Cell Chem. Biol. 2017, 24, 1416.
doi: 10.1016/j.chembiol.2017.08.022
Ong, S. E.; Blagoev, B.; Kratchmarova, I.; Kristensen, D. B.; Steen, H.; Pandey, A.; Mann, M. Mol. Cell. Proteomics 2002, 1, 376.
doi: 10.1074/mcp.M200025-MCP200
Wiese, S.; Reidegeld, K. A.; Meyer, H. E.; Warscheid, B. Proteomics 2007, 7, 340.
doi: 10.1002/(ISSN)1615-9861
Thompson, A.; Schäfer, J.; Kuhn, K.; Kienle, S.; Schwarz, J.; Schmidt, G.; Neumann, T.; Hamon, C. Anal. Chem. 2003, 75, 1895.
doi: 10.1021/ac0262560
Wang, J.; Gao, L.; Lee, Y. M.; Kalesh, K. A.; Ong, Y. S.; Lim, J.; Jee, J.-E.; Sun, H.; Lee, S. S.; Hua, Z.-C.; Lin, Q. Pharmacol. Therapeut. 2016, 162, 10.
doi: 10.1016/j.pharmthera.2016.01.010
Smith, G. P.; Petrenko, V. A. Chem. Rev. 1997, 97, 391.
doi: 10.1021/cr960065d
Jin, Y.; Yu, J.; Yu, Y. G. Chem. Biol. 2002, 9, 157.
doi: 10.1016/S1074-5521(02)00096-0
Takakusagi, Y.; Takakusagi, K.; Kuramochi, K.; Kobayashi, S.; Sugawara, F.; Sakaguchi, K. Bioorg. Med. Chem. 2007, 15, 7590.
doi: 10.1016/j.bmc.2007.09.002
Zhu, H.; Snyder, M. Curr. Opin. Chem. Biol. 2003, 7, 55.
doi: 10.1016/S1367-5931(02)00005-4
Lomenick, B.; Hao, R.; Jonai, N.; Chin, R. M.; Aghajan, M.; Warburton, S.; Wang, J.; Wu, R. P.; Gomez, F.; Loo, J. A.; Wohlschlegel, J. A.; Vondriska, T. M.; Pelletier, J.; Herschman, H. R.; Clardy, J.; Clarke, C. F.; Huang, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009, 106, 21984.
doi: 10.1073/pnas.0910040106
Chin, R. M.; Fu, X.; Pai, M. Y.; Vergnes, L.; Hwang, H.; Deng, G.; Diep, S.; Lomenick, B.; Meli, V. S.; Monsalve, G. C; Hu, E.; Whelan, S. A.; Wang, J. X.; Jung, G.; Solis, G. M.; Fazlollahi, F.; Kaweeteerawat, C.; Quach, A.; Nili, M.; Krall, A. S.; Godwin, H. A.; Chang, H. R.; Faull, K. F.; Guo, F.; Jiang, M.; Trauger, S. A.; Saghatelian, A.; Brass, D.; Christofk, H. R.; Clarke, C. F.; Teitell, M. A.; Petrascheck, M.; Reue, K.; Jung, M. E.; Frand, A. R.; Huang, J. Nature 2014, 510, 397.
doi: 10.1038/nature13264
Fleta-Soriano, E.; Martinez, J. P.; Hinkelmann, B.; Gerth, K.; Washausen, P.; Diez, J.; Frank, R.; Sasse, F.; Meyerhans, A. Microb. Cell Fact. 2014, 13, 17.
doi: 10.1186/1475-2859-13-17
Hu, Y. -S. Ph. D. Dissertation, Second Military Medical University, Shanghai, 2013(in Chinese).
Dal Piaz, F.; Vera Saltos, M. B.; Franceschelli, S.; Forte, G.; Marzocco, S.; Tuccinardi, T.; Poli, G.; Nejad Ebrahimi, S.; Hamburger, M.; De Tommasi, N.; Braca, A. J. Nat. Prod. 2016, 79, 2681.
doi: 10.1021/acs.jnatprod.6b00627
Molina, D. M.; Jafari, R.; Ignatushchenko, M.; Seki, T.; Larsson, E. A.; Dan, C.; Sreekumar, L.; Cao, Y.; Nordlund, P. Science 2013, 341, 84.
doi: 10.1126/science.1233606
Martinez, M. D.; Nordlund, P. Annu. Rev. Phamacol. 2016, 56, 141.
doi: 10.1146/annurev-pharmtox-010715-103715
Savitski, M. M.; Reinhard, F. B.; Franken, H.; Werner, T.; Savitski, M. F.; Eberhard, D.; Molina, D. M.; Jafari, R.; Dovega, R. B.; Klaeger, S.; Kuster, B. Science 2014, 346, 1255784.
doi: 10.1126/science.1255784
Reinhard, F. B.; Eberhard, D.; Werner, T.; Franken, H.; Childs, D.; Doce, C.; Savitski, M. F.; Huber, W.; Bantscheff, M.; Savitski, M. M.; Drewes, G. Nat. Methods 2015, 12, 1129.
doi: 10.1038/nmeth.3652
Huber, K. V.; Olek, K. M.; Müller, A. C.; Tan, C. S. H.; Bennett, K. L.; Colinge, J.; Superti-Furga, G. Nat. Methods 2015, 12, 1055.
doi: 10.1038/nmeth.3590
Becher, I.; Werner, T.; Doce, C.; Zaal, E. A.; Tögel, I.; Khan, C. A.; Rueger, A.; Muelbaier, M.; Salzer, E.; Berkers, C. R.; Fitzpatrick, P. F.; Bantscheff, M.; Savitski, M. M. Nat. Chem. Biol. 2016, 12, 908.
doi: 10.1038/nchembio.2185
Franken, H.; Mathieson, T.; Childs, D.; Sweetman, G. M.; Werner, T.; Tögel, I.; Doce, C.; Gade, S.; Bantscheff, M.; Drewes, G.; Reinhard, F. B. Nat. Protoc. 2015, 10, 1567.
doi: 10.1038/nprot.2015.101
Park, H.; Ha, J.; Koo, J. Y.; Park, J.; Park, S. B. Chem. Sci. 2017, 8, 1127.
doi: 10.1039/C6SC03238A
West, G. M.; Tucker, C. L.; Xu, T.; Park, S. K.; Han, X.; Yates, J. R.; Fitzgerald M. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010, 107, 9078.
doi: 10.1073/pnas.1000148107
Chan, J. N.; Vuckovic, D.; Sleno, L.; Olsen, J. B.; Pogoutse, O.; Havugimana, P. C.; Hewel, J. A.; Bajaj, N.; Wang, Y.; Musteata, M. F.; Nislw, C.; Emili, A. Mol. Cell. Proteomics 2012, 11, M111. 016642.
doi: 10.1074/mcp.M111.016642
Parsons, A. B.; Lopez, A.; Givoni, I. E.; Williams, D. E.; Gray, C. A.; Porter, J.; Chua, G.; Sopko, R.; Brost, R. L.; Ho, C. H.; Wang, J.; Ketela, T.; Brenner, C.; Brill, J. A.; Femandez, G. E.; Lorenz, T. C.; Payne, G. S.; Ishihara, S.; Ohya, Y.; Andrews, B.; Hughes, T. R.; Frey, B. J.; Graham, T. R.; Andersen, R. J.; Boone, C. Cell 2006, 126, 611.
doi: 10.1016/j.cell.2006.06.040
Ho, C. H.; Magtanong, L.; Barker, S. L.; Gresham, D.; Nishimura, S.; Natarajan, P.; Koh, J. L.; Porter, J.; Gray, C. A.; Andersen, R. J.; Giaever, G. Nat. Biotech. 2009, 27, 369.
doi: 10.1038/nbt.1534
Luesch, H.; Wu, T. Y.; Ren, P.; Gray, N. S.; Schultz, P. G.; Supek, F. Chem. Biol. 2005, 12, 55.
doi: 10.1016/j.chembiol.2004.10.015
Smith, A. M.; Ammar, R.; Nislow, C.; Giaever, G. Pharmacol. Therapeut. 2010, 127, 156.
doi: 10.1016/j.pharmthera.2010.04.012
Lum, P. Y.; Armour, C. D.; Stepaniants, S. B.; Cavet, G.; Wolf, M. K.; Butler, J. S.; Hinshaw, J. C.; Garnier, P.; Prestwich, G. D.; Leonardson, A.; Garrett-Engele, P.; Leonardson, A. Cell 2004, 116, 121.
doi: 10.1016/S0092-8674(03)01035-3
Sopko, R.; Huang, D.; Preston, N.; Chua, G.; Papp, B.; Kafadar, K.; Snyder, M.; Oliver, S. G.; Cyert, M.; Hughes, T. R.; Boone, C.; Andrews, B. Mol. Cell 2006, 21, 319.
doi: 10.1016/j.molcel.2005.12.011
Chen, X.; Ung, C. Y.; Chen, Y. Nat. Prod. Rep. 2003, 20, 432.
doi: 10.1039/b303745b
Chen, X.; Ji, Z. L.; Chen, Y. Z. Nucleic Acids Res. 2002, 30, 412.
doi: 10.1093/nar/30.1.412
Gao, Z.; Li, H.; Zhang, H.; Liu, X.; Kang, L.; Luo, X.; Zhu, W.; Chen, K.; Wang, X.; Jiang, H. BMC Bioinformatics 2008, 9, 104.
doi: 10.1186/1471-2105-9-104
Chen, L.; Oughtred, R.; Berman, H. M.; Westbrook, J. Bioinformatics 2004, 20, 2860.
doi: 10.1093/bioinformatics/bth300
Ji, Z. L.; Han, L. Y.; Yap, C. W.; Sun, L. Z.; Chen, X.; Chen, Y. Z. Drug Safety 2003, 26, 685.
doi: 10.2165/00002018-200326100-00002
Wishart, D. S.; Knox, C.; Guo, A. C.; Cheng, D.; Shrivastava, S.; Tzur, D.; Gautam, B.; Hassanali, M. Nucleic Acids Res. 2007, 36, D901.
Zhang, J. X.; Huang, W. J.; Zeng, J. H.; Huang, W. H.; Wang, Y.; Zhao, R.; Han, B. C.; Liu, Q. F.; Chen, Y. Z.; Ji, Z. L. Bioinformatics 2007, 23, 1710.
doi: 10.1093/bioinformatics/btm139
Chen, Y. Z.; Ung, C. Y. Am. J. Chin. Med. 2002, 30, 139.
doi: 10.1142/S0192415X02000156
Li, H.; Gao, Z.; Kang, L.; Zhang, H.; Yang, K.; Yu, K.; Luo, X.; Zhu, W.; Chen, K.; Shen, J.; Wang, X.; Jiang, H. Nucleic Acids Res. 2006, 34, W219.
doi: 10.1093/nar/gkl114
Liu, X.; Ouyang, S.; Yu, B.; Liu, Y.; Huang, K.; Gong, J.; Zheng, S.; Li, Z.; Li, H.; Jiang, H. Nucleic Acids Res. 2010, 38, W609.
doi: 10.1093/nar/gkq300
Kinnings, S. L.; Jackson, R. M. J. Chem. Inf. Model. 2011, 28, 624.
Wang, J. C.; Chu, P. Y.; Chen, C. M.; Lin, J. H. Nucleic Acids Res. 2012, 40, W393.
doi: 10.1093/nar/gks496
Friesner, R. A.; Banks, J. L.; Murphy, R. B.; Halgren, T. A.; Klicic, J. J.; Mainz, D. T.; Repasky, M. P.; Knoll, E. H.; Shelley, M.; Perry, J. K.; Shaw, D. E. J. Med. Chem. 2004, 47, 1739.
doi: 10.1021/jm0306430
Park, K.; Cho, A. E. J. Ginseng. Res. 2017, 41, 534.
doi: 10.1016/j.jgr.2016.10.005
Smith, A. M.; Ammar, R.; Nislow, C.; Giaever, G. Pharmacol. Therapeut. 2010, 127, 156.
doi: 10.1016/j.pharmthera.2010.04.012
Rees, M. G.; Seashore-Ludlow, B.; Cheah, J. H.; Adams, D. J.; Price, E. V.; Gill, S.; Javaid, S.; Coletti, M. E.; Jones, V. L.; Bodycombe, N. E.; Soule, C. K.; Alexander, B.; Li, A.; Montgomery, P.; Kotz, J. D.; Hon, C. S.; Munoz, B.; Liefeld, T.; Dancik, V.; Haber, D. A.; Clish, C. B.; Bittker, J. A.; Palmer, M.; Wagner, B. K.; Clemons, P. A.; Shamji, A. F.; Schreiber, S. L. Nat. Chem. Biol. 2016, 12, 109.
doi: 10.1038/nchembio.1986
Yue, Q.; Feng, L.; Cao, B.; Liu, M.; Zhang, D.; Wu, W.; Jiang, B.; Yang, M.; Liu, X.; Guo, D. Mol. Cell. Proteomics 2016, 15, 26.
doi: 10.1074/mcp.M115.053272
Prieto, J. H.; Koncarevic, S.; Park, S. K.; Yates, J.; Becker, K. PLoS One 2008, 3, e4098.
doi: 10.1371/journal.pone.0004098
Kong, Q.; Tong, Q.; Lou, D.; Ding, J.; Zheng, B.; Chen, R.; Zhu, X.; Chen, X.; Dong, K.; Lu, S. Mol. BioSyst. 2015, 11, 1400.
doi: 10.1039/C5MB00074B
Hansen, J.; Palmfeldt, J.; Vang, S.; Corydon, T. J.; Gregersen, N.; Bross, P. PLoS One 2011, 6, e26634.
doi: 10.1371/journal.pone.0026634
Xu, Y.; Wang, Y.; Yan, L.; Liang, R. M.; Dai, B. D.; Tang, R. J.; Gao, P. H., Jiang, Y. Y. J. Proteome Res. 2009, 8, 5296.
doi: 10.1021/pr9005074
D'Aguanno, S.; D'Agnano, I.; De Canio, M.; Rossi, C.; Bernardini, S.; Federici, G.; Urbani, A. Mol. BioSyst. 2012, 8, 1068.
doi: 10.1039/c2mb05498a
Towbin, H.; Bair, K. W.; DeCaprio, J. A.; Eck, M. J.; Kim, S.; Kinder, F. R.; Morollo, A.; Mueller, D. R.; Schindler, P.; Song, H. K.; Van Oostrum, J. J. Biol. Chem. 2003, 278, 52964.
doi: 10.1074/jbc.M309039200
Futamura, Y.; Kawatani, M.; Kazami, S.; Tanaka, K.; Muroi, M.; Shimizu, T.; Tomita, K.; Watanabe, N.; Osada, H. Chem. Biol. 2012, 19, 1620.
doi: 10.1016/j.chembiol.2012.10.014
Futamura, Y.; Yamamoto, K; Osada, H. Biosci. Biotechnol. Biochem. 2017, 81, 28.
doi: 10.1080/09168451.2016.1248365
Shoemaker, R. H. Nat. Rev. Cancer 2006, 6, 813.
doi: 10.1038/nrc1951
Bai, R.; Paull, K. D.; Herald, C. L.; Malspeis, L.; Pettit, G. R.; Hamel, E. J. Biol. Chem. 1991, 266, 15882.
Kurita, K. L.; Glassey, E.; Linington, R. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2015, 112, 11999.
doi: 10.1073/pnas.1507743112
Lu, Y.; Zhang, Y.; Li, L.; Feng, X.; Ding, S.; Zheng, W.; Li, J.; Shen, P. Chem. Biol. 2014, 21, 246.
doi: 10.1016/j.chembiol.2013.12.009
Leuenroth, S. J.; Okuhara, D.; Shotwell, J. D.; Markowitz, G. S.; Yu, Z.; Somlo, S.; Crews, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007, 104, 4389.
doi: 10.1073/pnas.0700499104
Corson, T. W.; Cavga, H.; Aberle, N.; Crews, C. M. ChemBioChem 2001, 12, 1767.
Vispé, S.; DeVries, L.; Créancier, L.; Besse, J.; Bréand, S.; Hobson, D. J.; Svejstrup, J. Q.; Annereau, J. P.; Cussac, D.; Dumontet, C.; Guilbaud, N. Mol. Cancer Therapeut. 2009, 8, 2780.
doi: 10.1158/1535-7163.MCT-09-0549
Leuenroth, S. J.; Crews, C. M. Chem. Biol. 2005, 12, 1259.
doi: 10.1016/j.chembiol.2005.09.009
McCallum, C.; Kwon, S.; Leavitt, P.; Shen, D. M.; Liu, W.; Gurnett, A. Immunobiology 2007, 212, 549.
doi: 10.1016/j.imbio.2007.02.002
Titov, D. V.; Gilman, B.; He, Q.-L.; Bhat, S.; Low, W. K.; Dang, Y.; Smeaton, M.; Demain, A. L.; Miller, P. S.; Kugel, J. F.; Goodrich, J. A.; Liu, J. O. Nat. Chem. Biol. 2011, 7, 182.
doi: 10.1038/nchembio.522
He, Q. L.; Titov, D. V.; Li, J.; Tan, M.; Ye, Z.; Zhao, Y.; Romo, D.; Liu, J. O. Angew. Chem. Int. Ed. 2015, 54, 1859.
doi: 10.1002/anie.201408817
McClary, B.; Zinshteyn, B.; Meyer, M.; Jouanneau, M.; Pellegrino, S.; Yusupova, G.; Schuller, A.; Reyes, J. C. P.; Lu, J.; Guo, Z.; Ayinde, S.; Luo, C.; Dang, Y.; Romo, D.; Yusupov, M.; Green, R.; Liu, J. O. Cell Chem. Biol. 2017, 24, 605.
doi: 10.1016/j.chembiol.2017.04.006
Koehn, F. E.; Carter, G. T. Nat. Rev. Drug Discov. 2005, 4, 206.
doi: 10.1038/nrd1657
Calson, E. E. ACS Chem. Biol. 2010, 5, 639.
doi: 10.1021/cb100105c
Gao, Y.; Hu, J.; Ju, Y. Acta Chim. Sinica 2016, 74, 312(in Chinese).
Rodrigues, T.; Reker, D.; Schneider, P.; Schneider, G. Nat. Chem. 2016, 8, 531.
doi: 10.1038/nchem.2479
Xu, Y.; Cheng, J. Chinese Sci. Bull. 2017, 62, 908(in Chinese).
Schenone, M.; Dancik, V.; Wagner, B. K.; Clemons, P. A. Nat. Chem. Biol. 2013, 9, 232.
doi: 10.1038/nchembio.1199
Titov, D. V.; Liu, J. O. Bioorgan. Med. Chem. 2012, 20, 1902.
doi: 10.1016/j.bmc.2011.11.070
Rix, U.; Superti-Furga, G. Nat. Chem. Biol. 2009, 5, 616.
doi: 10.1038/nchembio.216
Geoghegan, K. F.; Johnson, D. S. Annu. Rep. Med. Chem. 2010, 45, 345.
doi: 10.1016/S0065-7743(10)45021-6
Kawatani, M.; Osada, H. MedChemComm 2014, 5, 277.
doi: 10.1039/c3md00276d
Wang, C.; Chen, N. Acta Chim. Sinica 2015, 73, 657(in Chinese).
Harding, M. W.; Galat, A.; Uehling, D. E.; Schreiber, S. L. Nature 1989, 341, 758.
doi: 10.1038/341758a0
Taunton, J.; Hassig, C. A.; Schreiber, S. L. Science 1996, 272, 408.
doi: 10.1126/science.272.5260.408
Sin, N.; Meng, L.; Wang, M. Q.; Wen, J. J.; Bornmann, W. G.; Crews, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1997, 94, 6099.
doi: 10.1073/pnas.94.12.6099
Griffith, E. C.; Su, Z.; Turk, B. E.; Chen, S.; Chang, Y. H.; Wu, Z.; Biemann, K.; Liu, J. O. Chem. Biol. 1997, 4, 461.
doi: 10.1016/S1074-5521(97)90198-8
Griffith, E. C.; Su, Z.; Niwayama, S.; Ramsay, C. A.; Chang, Y.; Liu, J. O. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1998, 95, 15183.
doi: 10.1073/pnas.95.26.15183
Kudo, N.; Matsumori, N.; Taoka, H.; Fujiwara, D.; Scheriner, E. P.; Wolff, B.; Yoshida, M.; Horinouchi, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999, 96, 9112.
doi: 10.1073/pnas.96.16.9112
Low, W. K.; Dang, Y.; Schneider-Poetsch, T.; Shi, Z.; Choi, N. S.; Rzasa, R. M.; Shea, H. A.; Li, S.; Park, K.; Ma, G.; Romo, D.; Liu, J. O. Method. Enzymol. 2007, 431, 303.
doi: 10.1016/S0076-6879(07)31014-8
Yamaoka, M.; Sato, K.; Kobayashi, M.; Nishio, N.; Ohkubo, M.; Fujii, T.; Nakajima, H. J. Antibiot. 2005, 58, 654.
doi: 10.1038/ja.2005.90
Bargagna-Mohan, P.; Hamza, A.; Kim, Y. E.; Ho, Y. K. A.; Mor-Vaknin, N.; Wendschlag, N.; Liu, J.; Evans, R. M.; Mar-kovitz, D. M.; Zhan, C.; Kim, K. B.; Mohan, R. Chem. Biol. 2007, 14, 623.
doi: 10.1016/j.chembiol.2007.04.010
Ki, S. W.; Ishigami, K.; Kitahara, T.; Kasahara, K.; Yoshida, M.; Horinouchi, S. J. Biol. Chem. 2000, 275, 39231.
doi: 10.1074/jbc.M006192200
Dong, T.; Li, C.; Wang, X.; Dian, L.; Zhang, X.; Li, L.; Chen, S.; Cao, R.; Li, L.; Huang, N.; He, S.; Lei, X. Nat. Commun. 2015, 6, 6522.
doi: 10.1038/ncomms7522
Margarucci, L.; Monti, M. C.; Cassiano, C.; Mozzicafreddo, M.; Angeletti, M.; Riccio, R.; Tosco, A.; Casapullo, A. Chem. Commun. 2013, 49, 5844.
doi: 10.1039/c3cc41858h
Cassiano, C.; Margarucci, L.; Exposito, R.; Riccio, R.; Tosco, A.; Casapullo, A.; Monti, M. C. Chem. Commun. 2014, 50, 6043.
doi: 10.1039/C4CC00989D
Klaić, L.; Morimoto, R. I.; Silverman, R. B. ACS Chem. Biol. 2012, 7, 928.
doi: 10.1021/cb200539u
Li, J.; Casteels, T.; Frogne, T.; Ingvorsen, C.; Honore, C.; Courtney, M.; Huber, K. V. M.; Schminer, N.; Kimmel, R. A.; Ramanov, R. A.; Sturtzel, C.; Lardeau, C.; Klughammer, J.; Farlik, M.; Sdelci, S.; Vieira, A.; Avolio, F.; Briand, F.; Baburin, I.; Majek, P.; Pauler, F. M.; Penz, T.; Stukalov, A.; Gridling, M.; Parapatics, K.; Barbieux, C.; Berishvili, E.; Spittler, A.; Colinge, J.; Bennett, K.; Hering, S.; Sulpice, T.; Bock, C.; Distel, M.; Harkany, T.; Meyer, D.; Superti-Furga, G.; Collombat, R.; Hechsher-Sorensen, J.; Kubicek, S. Cell 2017, 168, 86.
doi: 10.1016/j.cell.2016.11.010
Kong, L. M.; Deng, X.; Zuo, Z. L.; Sun, H. D.; Zhao, Q. S.; Li, Y. Oncotarget 2014, 5, 11354.
Liu, C.; Yin, Q.; Zhou, H.; Wu, Y.; Pu, J.; Xia, L.; Liu, W.; Huang, X.; Jiang, T.; Wu, M.; He, L.; Zhao, Y.; Wang, X.; Xiao, W.; Chen, H.; Zhao, Q.; Zhou, A.; Wang, L.; Sun, H.; Chen, G. Nat. Chem. Biol. 2012, 8, 486.
doi: 10.1038/nchembio.935
Zhao, Q.; Ding, Y.; Deng, Z.; Lee, O. Y.; Gao, P.; Chen, P.; Rose, R. J.; Zhao, H.; Zhang, Z.; Tao, X.; Heck, A. J. R.; Kao, R.; Yang, D. Chem. Sci. 2015, 6, 4124.
doi: 10.1039/C5SC00633C
Li, D.; Li, C.; Li, L.; Chen, S.; Wang, L.; Li, Q.; Wang, X.; Lei, X.; Shen, Z. Cell Chem. Biol. 2016, 23, 257.
doi: 10.1016/j.chembiol.2015.08.018
Yi, C. M.; Yu, J.; Kim, H.; Lee, N. R.; Kim, S. W.; Lee, N. J.; Lee, J.; Seong, J.; Kim, N. J.; Inn, K. S. Chem. Commun. 2017, 53, 7045.
doi: 10.1039/C7CC02789C
Capolupo, A.; Esposito, R.; Zampella, A.; Festa, C.; Roccio, R.; Casapullo, A.; Tosco, A., Monti, M. C. J. Nat. Prod. 2017, 80, 909.
doi: 10.1021/acs.jnatprod.6b00793
Kanoh, N.; Kumashiro, S.; Simizu, S.; Kondoh, Y.; Hatakeyama, S.; Tashiro, H.; Osada, H. Angew. Chem. Int. Ed. 2003, 115, 5742.
doi: 10.1002/(ISSN)1521-3757
Kanoh, N.; Honda, K.; Simizu, S.; Muroi, M.; Osada, H. Angew. Chem. Int. Ed. 2005, 44, 3559.
doi: 10.1002/(ISSN)1521-3773
Hirohama, M.; Kumar, A.; Fukuda, I.; Matsuoka, S.; Igarashi, Y.; Saitoh, H.; Takagi, M.; Shinya, K.; Honda, K.; Kondoh, Y.; Saito, T.; Nakao, Y.; Osada, H.; Zhang, K. Y. J.; Yoshida, M.; Ito, A. ACS Chem. Biol. 2013, 8, 2635.
doi: 10.1021/cb400630z
Kolb, H. C.; Finn, M. G.; Sharpless, K. B. Angew. Chem. Int. Ed. 2001, 40, 2004.
doi: 10.1002/(ISSN)1521-3773
Kalesh, K. A.; Clulow, J. A.; Tate, E. W. Chem. Commun. 2015, 51, 5497.
doi: 10.1039/C4CC09527H
Ciepla, P.; Konitsiotis, A. D.; Serwa, R. A.; Masumoto, N.; Leong, W. P.; Dallman, M. J.; Magee, A. I.; Tate, E. W. Chem. Sci. 2014, 5, 4249.
doi: 10.1039/C4SC01600A
Kreuzer, J.; Bach, N. C.; Forler, D.; Sieber, S. A. Chem. Sci. 2015, 6, 237.
doi: 10.1039/C4SC02339K
Batternberg, O. A.; Yang, Y.; Verhelst, S. H. L.; Sieber, S. A. Mol. BioSyst. 2013, 9, 343.
doi: 10.1039/c2mb25446h
Wang, J.; Zhang, J.; Zhang, C.; Wong, Y. K.; Lim, T. K.; Hua, Z.; Liu, B.; Tannenbaum, S. R.; Shen, H.-M.; Lin, Q. Sci. Rep. 2016, 6, 22146.
doi: 10.1038/srep22146
Wang, J.; Tan, X. F.; Nguyen, V. S.; Yang, P.; Zhou, J.; Gao, M.; Li, Z.; Lim, T. K.; He, Y.; Ong, C. S.; Lay, Y.; Zhang, J.; Zhu, G.; Lai, S.-L.; Ghosh, D.; Mok, Y. K.; Shen, H.-M.; Lin, Q. Mol. Cell. Proteomics 2014, 13, M113. 029793.
Wang, J.; Zhang, C.; Chia, W.; Loh, C.; Li, Z.; Lee, Y.; He, Y.; Yuan, L.; Lim, T.; Liu, M.; Liew, C.; Lee, Y.; Zhang, J.; Lu, N.; Lim, C.; Hua, Z.; Liu, B.; Shen, H.-M.; Tan, S.; Lin, Q. Nat. Commun. 2015, 6, 10111.
doi: 10.1038/ncomms10111
Ismail, H. M.; Barton, V.; Phanchana, M.; Charoensutthivarakul, S.; Wong, M. H. L.; Hemingway, J.; Biagini, G. A.; O'Neill, P. M.; Ward, S. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2016, 113, 2080.
doi: 10.1073/pnas.1600459113
Zhou, Y.; Li, W.; Xiao, Y. ACS Chem. Biol. 2016, 11, 882.
doi: 10.1021/acschembio.5b01043
Zhou, Y.; Li, W.; Zhang, X.; Zhang, H.; Xiao, Y. Chem. Commun. 2016, 52, 14035.
doi: 10.1039/C6CC07581A
Li, J.; Cisar, J. S.; Zhou, C.-Y.; Vera, B.; Williams, H.; Rodrigurz, A. D.; Cravatt, B. F.; Romo, D. Nat. Chem. 2013, 5, 510.
doi: 10.1038/nchem.1653
Nishino, M.; Choy, J. W.; Gushwa, N. N.; Oses-Prieto, J. A.; Koupparis, K.; Burlingame, A. L.; Renslo, A. R.; McKerrow, J. H.; Taunton, J. eLife 2013, 2, e00712.
Zheng, B.; Zhu, S.; Wu, X. ACS Chem. Biol. 2015, 10, 115.
doi: 10.1021/cb500758s
Yang, J.; Tallman, K. A.; Porter, N. A.; Liebler, D. C. Anal. Chem. 2015, 87, 2535.
doi: 10.1021/ac504685y
Wright, M. H.; Tao, Y.; Drechsel, J.; Krysiak, J.; Chamni, S.; Weigert-Munoz, A.; Harvey, N. L.; Romo, D.; Sieber, S. A. Chem. Commun. 2017, DOI:10. 1039/C7CC04990K.
doi: 10.1039/C7CC04990K
Yang, M.; Chen, P. Acta Chim. Sinica 2015, 73, 783.
doi: 10.3866/PKU.WHXB201502062
Smith, E.; Collins, I. Future Med. Chem. 2015, 7, 159.
doi: 10.4155/fmc.14.152
Park, J.; Koh, M.; Koo, J. Y.; Lee, S.; Park, S. B. ACS Chem. Biol. 2015, 11, 44.
Kleiner, P.; Heydenreuter, W.; Stahl, M.; Korotkov, V. S.; Sieber, S. A. Angew. Chem. Int. Ed. 2017, 56, 1396.
doi: 10.1002/anie.201605993
Lamos, S. M.; Krusemark, C. J.; McGee, C. J.; Scalf, M.; Smith, L. M.; Belshaw, P. J. Angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 4329.
doi: 10.1002/(ISSN)1521-3773
Eirich, J.; Orth, R; Sieber, S. A. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 12144.
doi: 10.1021/ja2039979
Shi, H.; Cheng, X.; Sze, S. K.; Yao, S. Q. Chem. Commun. 2011, 47, 11306.
doi: 10.1039/c1cc14824a
Hulce, J. J.; Cognetta, A. B.; Niphakis, M.; Tull, S. E.; Cravatt, B. F. Nat. Methods 2012, 10, 259
Zhuang, S.; Li, Q.; Cai, L.; Wang, C.; Lei, X. ACS. Cent. Sci. 2017, 3, 501.
doi: 10.1021/acscentsci.7b00134
Konziase, B. Anal. Biochem. 2015, 482, 25.
doi: 10.1016/j.ab.2015.04.020
Guo, H.; Xu, J.; Hao, P.; Ding, K.; Li, Z. Chem. Commun. 2017, 53, 9620.
doi: 10.1039/C7CC04190J
Lehmann, J.; Richers, J.; Pothig, A.; Sieber, S. A. Chem. Commun. 2017, 53, 107.
doi: 10.1039/C6CC08365J
Wang, D.; Cao, Y.; Zheng, L.; Lv, D.; Chen, L.; Xing, X.; Zhu, Z.; Li, X.; Chai, Y. Chem. Commun. 2017, 53, 5020.
doi: 10.1039/C7CC02227A
Zhou, Y.; Di, Z.; Li, X.; Shan, Y.; Li, W.; Zhang, H.; Xiao, Y. Chem. Commun. 2017, 53, 8671.
doi: 10.1039/C7CC04345G
Wright, M. H.; Fetzer, C.; Sieber, S. A. J. Am. Chem. Soc. 2017, 139, 6152.
doi: 10.1021/jacs.7b01072
Tamura, T.; Tsukiji, S.; Hamachi, I. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 2216.
doi: 10.1021/ja209641t
Hughes, C. C.; Yang, Y.; Liu, W.; Dorrestein, P. C.; La Clair, J. J.; Fenical, W. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 12094.
doi: 10.1021/ja903149u
Li, G.; Liu, Y.; Liu, Y.; Chen, L.; Wu, S.; Liu, Y.; Li, X. Angew. Chem. Int. Ed. 2013, 52, 9544.
doi: 10.1002/anie.v52.36
Park, J.; Oh, S.; Park, S. B. Angew. Chem. Int. Ed. 2012, 51, 5447.
doi: 10.1002/anie.201200609
Leriche, G.; Chisholm, L.; Wagner, A. Bioorg. Med. Chem. 2012, 20, 571.
doi: 10.1016/j.bmc.2011.07.048
Li, W.; Zhou, Y.; Tang, G.; Xiao, Y. Bioconjugate Chem. 2016, 27, 2828.
doi: 10.1021/acs.bioconjchem.6b00556
Barglow, K. T.; Cravatt, B. F. Nat. Methods 2007, 4, 822.
doi: 10.1038/nmeth1092
Abegg, D.; Frei, R.; Cerato, L.; Prasad Hari, D.; Wang, C.; Waser, J.; Adibekian, A. Angew. Chem. Int. Ed. 2015, 54, 10852.
doi: 10.1002/anie.201505641
Wang, C.; Weerapana, E.; Blewett, M. M.; Cravatt, B. F. Nat. Methods 2014, 11, 79.
doi: 10.1038/nmeth.2759
Zhou, Y.; Li, W.; Wang, M.; Zhang, X.; Zhang, H.; Tong, X.; Xiao, Y. Mol. BioSyst. 2017, 13, 83.
doi: 10.1039/C6MB00691D
Grossman, E. A.; Ward, C. C.; Spradlin, J. N.; Bateman, L. A.; Huffman, T. R.; Miyamoto, D. K.; Kleinman, J. I.; Nomura, D. K. Cell Chem. Biol. 2017, 24, 1368.
doi: 10.1016/j.chembiol.2017.08.013
Tian, C.; Sun, R.; Liu, K.; Fu, L.; Liu, X.; Zhou, W.; Yang, Y.; Yang, J. Cell Chem. Biol. 2017, 24, 1416.
doi: 10.1016/j.chembiol.2017.08.022
Ong, S. E.; Blagoev, B.; Kratchmarova, I.; Kristensen, D. B.; Steen, H.; Pandey, A.; Mann, M. Mol. Cell. Proteomics 2002, 1, 376.
doi: 10.1074/mcp.M200025-MCP200
Wiese, S.; Reidegeld, K. A.; Meyer, H. E.; Warscheid, B. Proteomics 2007, 7, 340.
doi: 10.1002/(ISSN)1615-9861
Thompson, A.; Schäfer, J.; Kuhn, K.; Kienle, S.; Schwarz, J.; Schmidt, G.; Neumann, T.; Hamon, C. Anal. Chem. 2003, 75, 1895.
doi: 10.1021/ac0262560
Wang, J.; Gao, L.; Lee, Y. M.; Kalesh, K. A.; Ong, Y. S.; Lim, J.; Jee, J.-E.; Sun, H.; Lee, S. S.; Hua, Z.-C.; Lin, Q. Pharmacol. Therapeut. 2016, 162, 10.
doi: 10.1016/j.pharmthera.2016.01.010
Smith, G. P.; Petrenko, V. A. Chem. Rev. 1997, 97, 391.
doi: 10.1021/cr960065d
Jin, Y.; Yu, J.; Yu, Y. G. Chem. Biol. 2002, 9, 157.
doi: 10.1016/S1074-5521(02)00096-0
Takakusagi, Y.; Takakusagi, K.; Kuramochi, K.; Kobayashi, S.; Sugawara, F.; Sakaguchi, K. Bioorg. Med. Chem. 2007, 15, 7590.
doi: 10.1016/j.bmc.2007.09.002
Zhu, H.; Snyder, M. Curr. Opin. Chem. Biol. 2003, 7, 55.
doi: 10.1016/S1367-5931(02)00005-4
Lomenick, B.; Hao, R.; Jonai, N.; Chin, R. M.; Aghajan, M.; Warburton, S.; Wang, J.; Wu, R. P.; Gomez, F.; Loo, J. A.; Wohlschlegel, J. A.; Vondriska, T. M.; Pelletier, J.; Herschman, H. R.; Clardy, J.; Clarke, C. F.; Huang, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009, 106, 21984.
doi: 10.1073/pnas.0910040106
Chin, R. M.; Fu, X.; Pai, M. Y.; Vergnes, L.; Hwang, H.; Deng, G.; Diep, S.; Lomenick, B.; Meli, V. S.; Monsalve, G. C; Hu, E.; Whelan, S. A.; Wang, J. X.; Jung, G.; Solis, G. M.; Fazlollahi, F.; Kaweeteerawat, C.; Quach, A.; Nili, M.; Krall, A. S.; Godwin, H. A.; Chang, H. R.; Faull, K. F.; Guo, F.; Jiang, M.; Trauger, S. A.; Saghatelian, A.; Brass, D.; Christofk, H. R.; Clarke, C. F.; Teitell, M. A.; Petrascheck, M.; Reue, K.; Jung, M. E.; Frand, A. R.; Huang, J. Nature 2014, 510, 397.
doi: 10.1038/nature13264
Fleta-Soriano, E.; Martinez, J. P.; Hinkelmann, B.; Gerth, K.; Washausen, P.; Diez, J.; Frank, R.; Sasse, F.; Meyerhans, A. Microb. Cell Fact. 2014, 13, 17.
doi: 10.1186/1475-2859-13-17
Hu, Y. -S. Ph. D. Dissertation, Second Military Medical University, Shanghai, 2013(in Chinese).
Dal Piaz, F.; Vera Saltos, M. B.; Franceschelli, S.; Forte, G.; Marzocco, S.; Tuccinardi, T.; Poli, G.; Nejad Ebrahimi, S.; Hamburger, M.; De Tommasi, N.; Braca, A. J. Nat. Prod. 2016, 79, 2681.
doi: 10.1021/acs.jnatprod.6b00627
Molina, D. M.; Jafari, R.; Ignatushchenko, M.; Seki, T.; Larsson, E. A.; Dan, C.; Sreekumar, L.; Cao, Y.; Nordlund, P. Science 2013, 341, 84.
doi: 10.1126/science.1233606
Martinez, M. D.; Nordlund, P. Annu. Rev. Phamacol. 2016, 56, 141.
doi: 10.1146/annurev-pharmtox-010715-103715
Savitski, M. M.; Reinhard, F. B.; Franken, H.; Werner, T.; Savitski, M. F.; Eberhard, D.; Molina, D. M.; Jafari, R.; Dovega, R. B.; Klaeger, S.; Kuster, B. Science 2014, 346, 1255784.
doi: 10.1126/science.1255784
Reinhard, F. B.; Eberhard, D.; Werner, T.; Franken, H.; Childs, D.; Doce, C.; Savitski, M. F.; Huber, W.; Bantscheff, M.; Savitski, M. M.; Drewes, G. Nat. Methods 2015, 12, 1129.
doi: 10.1038/nmeth.3652
Huber, K. V.; Olek, K. M.; Müller, A. C.; Tan, C. S. H.; Bennett, K. L.; Colinge, J.; Superti-Furga, G. Nat. Methods 2015, 12, 1055.
doi: 10.1038/nmeth.3590
Becher, I.; Werner, T.; Doce, C.; Zaal, E. A.; Tögel, I.; Khan, C. A.; Rueger, A.; Muelbaier, M.; Salzer, E.; Berkers, C. R.; Fitzpatrick, P. F.; Bantscheff, M.; Savitski, M. M. Nat. Chem. Biol. 2016, 12, 908.
doi: 10.1038/nchembio.2185
Franken, H.; Mathieson, T.; Childs, D.; Sweetman, G. M.; Werner, T.; Tögel, I.; Doce, C.; Gade, S.; Bantscheff, M.; Drewes, G.; Reinhard, F. B. Nat. Protoc. 2015, 10, 1567.
doi: 10.1038/nprot.2015.101
Park, H.; Ha, J.; Koo, J. Y.; Park, J.; Park, S. B. Chem. Sci. 2017, 8, 1127.
doi: 10.1039/C6SC03238A
West, G. M.; Tucker, C. L.; Xu, T.; Park, S. K.; Han, X.; Yates, J. R.; Fitzgerald M. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010, 107, 9078.
doi: 10.1073/pnas.1000148107
Chan, J. N.; Vuckovic, D.; Sleno, L.; Olsen, J. B.; Pogoutse, O.; Havugimana, P. C.; Hewel, J. A.; Bajaj, N.; Wang, Y.; Musteata, M. F.; Nislw, C.; Emili, A. Mol. Cell. Proteomics 2012, 11, M111. 016642.
doi: 10.1074/mcp.M111.016642
Parsons, A. B.; Lopez, A.; Givoni, I. E.; Williams, D. E.; Gray, C. A.; Porter, J.; Chua, G.; Sopko, R.; Brost, R. L.; Ho, C. H.; Wang, J.; Ketela, T.; Brenner, C.; Brill, J. A.; Femandez, G. E.; Lorenz, T. C.; Payne, G. S.; Ishihara, S.; Ohya, Y.; Andrews, B.; Hughes, T. R.; Frey, B. J.; Graham, T. R.; Andersen, R. J.; Boone, C. Cell 2006, 126, 611.
doi: 10.1016/j.cell.2006.06.040
Ho, C. H.; Magtanong, L.; Barker, S. L.; Gresham, D.; Nishimura, S.; Natarajan, P.; Koh, J. L.; Porter, J.; Gray, C. A.; Andersen, R. J.; Giaever, G. Nat. Biotech. 2009, 27, 369.
doi: 10.1038/nbt.1534
Luesch, H.; Wu, T. Y.; Ren, P.; Gray, N. S.; Schultz, P. G.; Supek, F. Chem. Biol. 2005, 12, 55.
doi: 10.1016/j.chembiol.2004.10.015
Smith, A. M.; Ammar, R.; Nislow, C.; Giaever, G. Pharmacol. Therapeut. 2010, 127, 156.
doi: 10.1016/j.pharmthera.2010.04.012
Lum, P. Y.; Armour, C. D.; Stepaniants, S. B.; Cavet, G.; Wolf, M. K.; Butler, J. S.; Hinshaw, J. C.; Garnier, P.; Prestwich, G. D.; Leonardson, A.; Garrett-Engele, P.; Leonardson, A. Cell 2004, 116, 121.
doi: 10.1016/S0092-8674(03)01035-3
Sopko, R.; Huang, D.; Preston, N.; Chua, G.; Papp, B.; Kafadar, K.; Snyder, M.; Oliver, S. G.; Cyert, M.; Hughes, T. R.; Boone, C.; Andrews, B. Mol. Cell 2006, 21, 319.
doi: 10.1016/j.molcel.2005.12.011
Chen, X.; Ung, C. Y.; Chen, Y. Nat. Prod. Rep. 2003, 20, 432.
doi: 10.1039/b303745b
Chen, X.; Ji, Z. L.; Chen, Y. Z. Nucleic Acids Res. 2002, 30, 412.
doi: 10.1093/nar/30.1.412
Gao, Z.; Li, H.; Zhang, H.; Liu, X.; Kang, L.; Luo, X.; Zhu, W.; Chen, K.; Wang, X.; Jiang, H. BMC Bioinformatics 2008, 9, 104.
doi: 10.1186/1471-2105-9-104
Chen, L.; Oughtred, R.; Berman, H. M.; Westbrook, J. Bioinformatics 2004, 20, 2860.
doi: 10.1093/bioinformatics/bth300
Ji, Z. L.; Han, L. Y.; Yap, C. W.; Sun, L. Z.; Chen, X.; Chen, Y. Z. Drug Safety 2003, 26, 685.
doi: 10.2165/00002018-200326100-00002
Wishart, D. S.; Knox, C.; Guo, A. C.; Cheng, D.; Shrivastava, S.; Tzur, D.; Gautam, B.; Hassanali, M. Nucleic Acids Res. 2007, 36, D901.
Zhang, J. X.; Huang, W. J.; Zeng, J. H.; Huang, W. H.; Wang, Y.; Zhao, R.; Han, B. C.; Liu, Q. F.; Chen, Y. Z.; Ji, Z. L. Bioinformatics 2007, 23, 1710.
doi: 10.1093/bioinformatics/btm139
Chen, Y. Z.; Ung, C. Y. Am. J. Chin. Med. 2002, 30, 139.
doi: 10.1142/S0192415X02000156
Li, H.; Gao, Z.; Kang, L.; Zhang, H.; Yang, K.; Yu, K.; Luo, X.; Zhu, W.; Chen, K.; Shen, J.; Wang, X.; Jiang, H. Nucleic Acids Res. 2006, 34, W219.
doi: 10.1093/nar/gkl114
Liu, X.; Ouyang, S.; Yu, B.; Liu, Y.; Huang, K.; Gong, J.; Zheng, S.; Li, Z.; Li, H.; Jiang, H. Nucleic Acids Res. 2010, 38, W609.
doi: 10.1093/nar/gkq300
Kinnings, S. L.; Jackson, R. M. J. Chem. Inf. Model. 2011, 28, 624.
Wang, J. C.; Chu, P. Y.; Chen, C. M.; Lin, J. H. Nucleic Acids Res. 2012, 40, W393.
doi: 10.1093/nar/gks496
Friesner, R. A.; Banks, J. L.; Murphy, R. B.; Halgren, T. A.; Klicic, J. J.; Mainz, D. T.; Repasky, M. P.; Knoll, E. H.; Shelley, M.; Perry, J. K.; Shaw, D. E. J. Med. Chem. 2004, 47, 1739.
doi: 10.1021/jm0306430
Park, K.; Cho, A. E. J. Ginseng. Res. 2017, 41, 534.
doi: 10.1016/j.jgr.2016.10.005
Smith, A. M.; Ammar, R.; Nislow, C.; Giaever, G. Pharmacol. Therapeut. 2010, 127, 156.
doi: 10.1016/j.pharmthera.2010.04.012
Rees, M. G.; Seashore-Ludlow, B.; Cheah, J. H.; Adams, D. J.; Price, E. V.; Gill, S.; Javaid, S.; Coletti, M. E.; Jones, V. L.; Bodycombe, N. E.; Soule, C. K.; Alexander, B.; Li, A.; Montgomery, P.; Kotz, J. D.; Hon, C. S.; Munoz, B.; Liefeld, T.; Dancik, V.; Haber, D. A.; Clish, C. B.; Bittker, J. A.; Palmer, M.; Wagner, B. K.; Clemons, P. A.; Shamji, A. F.; Schreiber, S. L. Nat. Chem. Biol. 2016, 12, 109.
doi: 10.1038/nchembio.1986
Yue, Q.; Feng, L.; Cao, B.; Liu, M.; Zhang, D.; Wu, W.; Jiang, B.; Yang, M.; Liu, X.; Guo, D. Mol. Cell. Proteomics 2016, 15, 26.
doi: 10.1074/mcp.M115.053272
Prieto, J. H.; Koncarevic, S.; Park, S. K.; Yates, J.; Becker, K. PLoS One 2008, 3, e4098.
doi: 10.1371/journal.pone.0004098
Kong, Q.; Tong, Q.; Lou, D.; Ding, J.; Zheng, B.; Chen, R.; Zhu, X.; Chen, X.; Dong, K.; Lu, S. Mol. BioSyst. 2015, 11, 1400.
doi: 10.1039/C5MB00074B
Hansen, J.; Palmfeldt, J.; Vang, S.; Corydon, T. J.; Gregersen, N.; Bross, P. PLoS One 2011, 6, e26634.
doi: 10.1371/journal.pone.0026634
Xu, Y.; Wang, Y.; Yan, L.; Liang, R. M.; Dai, B. D.; Tang, R. J.; Gao, P. H., Jiang, Y. Y. J. Proteome Res. 2009, 8, 5296.
doi: 10.1021/pr9005074
D'Aguanno, S.; D'Agnano, I.; De Canio, M.; Rossi, C.; Bernardini, S.; Federici, G.; Urbani, A. Mol. BioSyst. 2012, 8, 1068.
doi: 10.1039/c2mb05498a
Towbin, H.; Bair, K. W.; DeCaprio, J. A.; Eck, M. J.; Kim, S.; Kinder, F. R.; Morollo, A.; Mueller, D. R.; Schindler, P.; Song, H. K.; Van Oostrum, J. J. Biol. Chem. 2003, 278, 52964.
doi: 10.1074/jbc.M309039200
Futamura, Y.; Kawatani, M.; Kazami, S.; Tanaka, K.; Muroi, M.; Shimizu, T.; Tomita, K.; Watanabe, N.; Osada, H. Chem. Biol. 2012, 19, 1620.
doi: 10.1016/j.chembiol.2012.10.014
Futamura, Y.; Yamamoto, K; Osada, H. Biosci. Biotechnol. Biochem. 2017, 81, 28.
doi: 10.1080/09168451.2016.1248365
Shoemaker, R. H. Nat. Rev. Cancer 2006, 6, 813.
doi: 10.1038/nrc1951
Bai, R.; Paull, K. D.; Herald, C. L.; Malspeis, L.; Pettit, G. R.; Hamel, E. J. Biol. Chem. 1991, 266, 15882.
Kurita, K. L.; Glassey, E.; Linington, R. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2015, 112, 11999.
doi: 10.1073/pnas.1507743112
Lu, Y.; Zhang, Y.; Li, L.; Feng, X.; Ding, S.; Zheng, W.; Li, J.; Shen, P. Chem. Biol. 2014, 21, 246.
doi: 10.1016/j.chembiol.2013.12.009
Leuenroth, S. J.; Okuhara, D.; Shotwell, J. D.; Markowitz, G. S.; Yu, Z.; Somlo, S.; Crews, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007, 104, 4389.
doi: 10.1073/pnas.0700499104
Corson, T. W.; Cavga, H.; Aberle, N.; Crews, C. M. ChemBioChem 2001, 12, 1767.
Vispé, S.; DeVries, L.; Créancier, L.; Besse, J.; Bréand, S.; Hobson, D. J.; Svejstrup, J. Q.; Annereau, J. P.; Cussac, D.; Dumontet, C.; Guilbaud, N. Mol. Cancer Therapeut. 2009, 8, 2780.
doi: 10.1158/1535-7163.MCT-09-0549
Leuenroth, S. J.; Crews, C. M. Chem. Biol. 2005, 12, 1259.
doi: 10.1016/j.chembiol.2005.09.009
McCallum, C.; Kwon, S.; Leavitt, P.; Shen, D. M.; Liu, W.; Gurnett, A. Immunobiology 2007, 212, 549.
doi: 10.1016/j.imbio.2007.02.002
Titov, D. V.; Gilman, B.; He, Q.-L.; Bhat, S.; Low, W. K.; Dang, Y.; Smeaton, M.; Demain, A. L.; Miller, P. S.; Kugel, J. F.; Goodrich, J. A.; Liu, J. O. Nat. Chem. Biol. 2011, 7, 182.
doi: 10.1038/nchembio.522
He, Q. L.; Titov, D. V.; Li, J.; Tan, M.; Ye, Z.; Zhao, Y.; Romo, D.; Liu, J. O. Angew. Chem. Int. Ed. 2015, 54, 1859.
doi: 10.1002/anie.201408817
McClary, B.; Zinshteyn, B.; Meyer, M.; Jouanneau, M.; Pellegrino, S.; Yusupova, G.; Schuller, A.; Reyes, J. C. P.; Lu, J.; Guo, Z.; Ayinde, S.; Luo, C.; Dang, Y.; Romo, D.; Yusupov, M.; Green, R.; Liu, J. O. Cell Chem. Biol. 2017, 24, 605.
doi: 10.1016/j.chembiol.2017.04.006
Tao Yang , Kaijiao Duan , Siyu Li , Jing Wei , Qingdi Yang , Qian Wang . A Comprehensive and Innovative Chemical Experimental Teaching: Extraction and Identification of Tea Polyphenols from Pu'er Tea and the Application in Hand Cream Making. University Chemistry, 2024, 39(8): 270-275. doi: 10.3866/PKU.DXHX202312040
Xinyi Hong , Tailing Xue , Zhou Xu , Enrong Xie , Mingkai Wu , Qingqing Wang , Lina Wu . Non-Site-Specific Fluorescent Labeling of Proteins as a Chemical Biology Experiment. University Chemistry, 2024, 39(4): 351-360. doi: 10.3866/PKU.DXHX202310010
Lijuan Wang , Yuping Ning , Jian Li , Sha Luo , Xiongfei Luo , Ruiwen Wang . Enhancing the Advanced Nature of Natural Product Chemistry Laboratory Courses with New Research Findings: A Case Study of the Application of Berberine Hydrochloride in Photodynamic Antimicrobial Films. University Chemistry, 2024, 39(11): 241-250. doi: 10.12461/PKU.DXHX202403017
Zhibei Qu , Changxin Wang , Lei Li , Jiaze Li , Jun Zhang . Organoid-on-a-Chip for Drug Screening and the Inherent Biochemistry Principles. University Chemistry, 2024, 39(7): 278-286. doi: 10.3866/PKU.DXHX202311039
Zihan Lin , Wanzhen Lin , Fa-Jie Chen . Electrochemical Modifications of Native Peptides. University Chemistry, 2025, 40(3): 318-327. doi: 10.12461/PKU.DXHX202406089
Xue Dong , Xiaofu Sun , Shuaiqiang Jia , Shitao Han , Dawei Zhou , Ting Yao , Min Wang , Minghui Fang , Haihong Wu , Buxing Han . 碳修饰的铜催化剂实现安培级电流电化学还原CO2制C2+产物. Acta Physico-Chimica Sinica, 2025, 41(3): 2404012-. doi: 10.3866/PKU.WHXB202404012
Yang Liu , Peng Chen , Lei Liu . Chemistry “101 Plan”: Design and Construction of Chemical Biology Textbook. University Chemistry, 2024, 39(10): 45-51. doi: 10.12461/PKU.DXHX202407085
Tianyu Feng , Guifang Jia , Peng Zou , Jun Huang , Zhanxia Lü , Zhen Gao , Chu Wang . Construction of the Chemistry Biology Experiment Course in the Chemistry “101 Program”. University Chemistry, 2024, 39(10): 69-77. doi: 10.12461/PKU.DXHX202409002
Jia Huo , Jia Li , Yongjun Li , Yuzhi Wang . Ideological and Political Design of Physical Chemistry Teaching: Chemical Potential of Any Component in an Ideal-Dilute Solution. University Chemistry, 2024, 39(2): 14-20. doi: 10.3866/PKU.DXHX202307075
Weina Wang , Lixia Feng , Fengyi Liu , Wenliang Wang . Computational Chemistry Experiments in Facilitating the Study of Organic Reaction Mechanism: A Case Study of Electrophilic Addition of HCl to Asymmetric Alkenes. University Chemistry, 2025, 40(3): 206-214. doi: 10.12461/PKU.DXHX202407022
Wanqun Hu , Pingping Zhu , Yuan Zheng , Wanqun Zhang , Wei Shao , Hong Wu , Qiang Zhou , Kaiping Yang , Xiang Sheng . Design and Practice of Ideological and Political Case Study in Instrumental Analysis Experiment Course: the Extraction and Structural Identification of Artemisinin. University Chemistry, 2024, 39(2): 203-207. doi: 10.3866/PKU.DXHX202310062
Shui Hu , Houjin Li , Zhenming Zang , Lianyun Li , Rong Lai . Integration of Science and Education Promotes the Construction of Undergraduate-to-Master’s Integration Experimental Courses: A Case Study on the Extraction, Separation and Identification of Artemisinin from Artemisia annua. University Chemistry, 2024, 39(4): 314-321. doi: 10.3866/PKU.DXHX202310063
Bing Sun . Practice of Ideological and Political Education in Physical Chemistry Courses for Non-Chemistry Majors. University Chemistry, 2024, 39(8): 28-35. doi: 10.3866/PKU.DXHX202311080
Weitai Wu , Laiying Zhang , Yuan Chun , Liang Qiao , Bin Ren . Course Design of Chemical Measurement Experiments in Chemistry “101 Plan”. University Chemistry, 2024, 39(10): 64-68. doi: 10.12461/PKU.DXHX202409031
Laiying Zhang , Weitai Wu , Yiru Wang , Shunliu Deng , Zhaobin Chen , Jiajia Chen , Bin Ren . Practices for Improving the Course of Chemical Measurement Experiments in the Chemistry “101 Plan”. University Chemistry, 2024, 39(10): 107-112. doi: 10.12461/PKU.DXHX202409032
Zian Lin , Yingxue Jin . Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Mass Spectrometry (MALDI-MS) for Disease Marker Screening and Identification: A Comprehensive Experiment Teaching Reform in Instrumental Analysis. University Chemistry, 2024, 39(11): 327-334. doi: 10.12461/PKU.DXHX202403066
Jianfeng Yan , Yating Xiao , Xin Zuo , Caixia Lin , Yaofeng Yuan . Comprehensive Chemistry Experimental Design of Ferrocenylphenyl Derivatives. University Chemistry, 2024, 39(4): 329-337. doi: 10.3866/PKU.DXHX202310005
Tongqi Ye , Qi Wang , Yuewen Ye , Yanqing Wang , Hongyang Zhou , Xianghua Kong . Reflection on the Reform of Physical Chemistry Teaching under the Background of “Intelligent Chemical Engineering”. University Chemistry, 2024, 39(3): 167-173. doi: 10.3866/PKU.DXHX202308116
Hongmei Zhao , Ziqiang Lu , Song Li , Xingyu Li , Chengting Zi , Xingli Fan , Xiangdong Qin . Exploration and Practice of Physical Chemistry Teaching under the Guidance of Course Ideological and Political Education. University Chemistry, 2024, 39(3): 210-217. doi: 10.3866/PKU.DXHX202309006
Youjun Fan , Dandan Cai , Wei Chen , Jianhua Qiu . Exploration and Practice of Ideological and Political Education Reform in Physical Chemistry Experiment. University Chemistry, 2024, 39(4): 119-124. doi: 10.3866/PKU.DXHX202310123