原子电荷计算方法的对比

卢天 陈飞武

引用本文: 卢天, 陈飞武. 原子电荷计算方法的对比[J]. 物理化学学报, 2012, 28(01): 1-18. doi: 10.3866/PKU.WHXB2012281 shu
Citation:  LU Tian, CHEN Fei-Wu. Comparison of Computational Methods for Atomic Charges[J]. Acta Physico-Chimica Sinica, 2012, 28(01): 1-18. doi: 10.3866/PKU.WHXB2012281 shu

原子电荷计算方法的对比

  • 基金项目:

    国家自然科学基金(20773011)资助项目 (20773011)

摘要: 原子电荷是对化学体系中电荷分布最简单、最直观的描述形式之一, 在理论和实际应用中都有重要意义. 本文介绍了12种重要的原子电荷计算方法的原理和特点, 通过大量实例从不同角度比较了它们的优缺点.这些方法包括Mulliken、分子环境中的原子轨道(AOIM)、Hirshfeld、原子偶极矩校正的Hirshfeld 布居(ADCH)、自然布居分析(NPA)、Merz-Kollmann (MK)、分子中的原子(AIM)、Merck 分子力场94 (MMFF94)、AM1-BCC、Gasteiger、电荷模型2(CM2)以及电荷均衡(QEq)方法. 最后本文对如何在实际应用中选择合适的计算方法给出了建议.

English

    1. [1]

      (1) Qian, B. H.; Ma,W. X.; Lu, L. D.; Yang, X. J.;Wang, X. Acta Phys. -Chim. Sin. 2010, 26, 610. [钱保华, 马卫兴, 陆路德, 杨绪杰, 汪信. 物理化学学报, 2010, 26, 610.](1) Qian, B. H.; Ma,W. X.; Lu, L. D.; Yang, X. J.;Wang, X. Acta Phys. -Chim. Sin. 2010, 26, 610. [钱保华, 马卫兴, 陆路德, 杨绪杰, 汪信. 物理化学学报, 2010, 26, 610.]

    2. [2]

      (2) Zheng,W. R.; Xu, J. L.; Xiong, R. Acta Phys. -Chim. Sin. 2010, 26, 2535. [郑文锐, 徐菁利, 熊瑞. 物理化学学报, 2010, 26, 2535.](2) Zheng,W. R.; Xu, J. L.; Xiong, R. Acta Phys. -Chim. Sin. 2010, 26, 2535. [郑文锐, 徐菁利, 熊瑞. 物理化学学报, 2010, 26, 2535.]

    3. [3]

      (3) Shen, T.; Du, F. P.; Liu, T.; Yao, G.W.;Wu, Z.; Fang, M. M.; Xu, X. J.; Lu, H. Z. Acta Phys. -Chim. Sin. 2011, 27, 1831. [申涛, 杜凤沛, 刘婷, 姚广伟, 吴峥, 方萌萌, 徐筱杰, 路慧哲. 物理化学学报, 2011, 27, 1831.](3) Shen, T.; Du, F. P.; Liu, T.; Yao, G.W.;Wu, Z.; Fang, M. M.; Xu, X. J.; Lu, H. Z. Acta Phys. -Chim. Sin. 2011, 27, 1831. [申涛, 杜凤沛, 刘婷, 姚广伟, 吴峥, 方萌萌, 徐筱杰, 路慧哲. 物理化学学报, 2011, 27, 1831.]

    4. [4]

      (4) Zhou, J. J.; Chen, H. M.; Xie, G. R.; Ren, T. R.; Xu, Z. H. Prog. Chem. 1998, 10, 55. [周家驹, 陈红明, 谢桂荣, 任天瑞, 许志宏. 化学进展, 1998, 10, 55.](4) Zhou, J. J.; Chen, H. M.; Xie, G. R.; Ren, T. R.; Xu, Z. H. Prog. Chem. 1998, 10, 55. [周家驹, 陈红明, 谢桂荣, 任天瑞, 许志宏. 化学进展, 1998, 10, 55.]

    5. [5]

      (5) Ji, G. D.; Zhao, Y. H.; Yuan, X. J. Northeast Normal Univ. (Natural Science Edition) 1998, 47. [籍国东, 赵元慧, 袁星. 东北师范大学学报(自然科学版), 1998, 47.](5) Ji, G. D.; Zhao, Y. H.; Yuan, X. J. Northeast Normal Univ. (Natural Science Edition) 1998, 47. [籍国东, 赵元慧, 袁星. 东北师范大学学报(自然科学版), 1998, 47.]

    6. [6]

      (6) Ding, Y. F.; Zhang, Y.; Zhang, D. H.; Li, Z. P. Acta Phys. -Chim. Sin. 2010, 26, 1651. [丁元法, 张跃, 张大海, 李仲平. 物理化学学报, 2010, 26, 1651.](6) Ding, Y. F.; Zhang, Y.; Zhang, D. H.; Li, Z. P. Acta Phys. -Chim. Sin. 2010, 26, 1651. [丁元法, 张跃, 张大海, 李仲平. 物理化学学报, 2010, 26, 1651.]

    7. [7]

      (7) Laio, A.; VandeVondele, J.; Rothlisberger, U. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 7300.  (7) Laio, A.; VandeVondele, J.; Rothlisberger, U. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 7300.  

    8. [8]

      (8) Pipek, J.; Mezey, P. G. J. Chem. Phys. 1989, 90, 4916.  (8) Pipek, J.; Mezey, P. G. J. Chem. Phys. 1989, 90, 4916.  

    9. [9]

      (9) Elstner, M.; Porezag, D.; Jungnickel, G.; Elsner, J.; Haugk, M.; Frauenheim, T.; Suhai, S.; Seifert, G. Phys. Rev. B 1998, 58, 7260.  (9) Elstner, M.; Porezag, D.; Jungnickel, G.; Elsner, J.; Haugk, M.; Frauenheim, T.; Suhai, S.; Seifert, G. Phys. Rev. B 1998, 58, 7260.  

    10. [10]

      (10) Giesen, D. J.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. 1995, 99, 7137.  (10) Giesen, D. J.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. 1995, 99, 7137.  

    11. [11]

      (11) Giesen, D. J.; Hawkins, G. D.; Liotard, D. A.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. Theor. Chem. Acc. 1997, 98, 85.  (11) Giesen, D. J.; Hawkins, G. D.; Liotard, D. A.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. Theor. Chem. Acc. 1997, 98, 85.  

    12. [12]

      (12) Li, J. B.; Hawkins, G. D.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. Chem. Phys. Lett. 1998, 288, 293.  (12) Li, J. B.; Hawkins, G. D.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. Chem. Phys. Lett. 1998, 288, 293.  

    13. [13]

      (13) Thompson, J. D.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 6532.  (13) Thompson, J. D.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 6532.  

    14. [14]

      (14) Meister, J.; Schwarz,W. H. E. J. Phys. Chem. 1994, 98, 8245.  (14) Meister, J.; Schwarz,W. H. E. J. Phys. Chem. 1994, 98, 8245.  

    15. [15]

      (15) Cramer, C. J. Essentials of Computational Chemistry, 2nd ed.; JohnWiley & Sons:West Sussex, 2004; pp 309-324.(15) Cramer, C. J. Essentials of Computational Chemistry, 2nd ed.; JohnWiley & Sons:West Sussex, 2004; pp 309-324.

    16. [16]

      (16) Jensen, F. Introduction to Computational Chemistry, 2nd ed.; JohnWiley & Sons:West Sussex, 2007; pp 293-304.(16) Jensen, F. Introduction to Computational Chemistry, 2nd ed.; JohnWiley & Sons:West Sussex, 2007; pp 293-304.

    17. [17]

      (17) Young, D. C. Computational Chemistry; JohnWiley & Sons: New York, 2001; pp 99-105.(17) Young, D. C. Computational Chemistry; JohnWiley & Sons: New York, 2001; pp 99-105.

    18. [18]

      (18) Cioslowski, J. ElectronicWavefunction Analysis. In Encyclopedia of Computational Chemistry; Schleyer, P. v. R. Ed.; JohnWiley & Sons:West Sussex, 1998; Vol. 2, pp 892-905.(18) Cioslowski, J. ElectronicWavefunction Analysis. In Encyclopedia of Computational Chemistry; Schleyer, P. v. R. Ed.; JohnWiley & Sons:West Sussex, 1998; Vol. 2, pp 892-905.

    19. [19]

      (19) Mulliken, R. S. J. Chem. Phys. 1955, 23, 1841.  (19) Mulliken, R. S. J. Chem. Phys. 1955, 23, 1841.  

    20. [20]

      (20) Mulliken, R. S. J. Chem. Phys. 1955, 23, 1833.  (20) Mulliken, R. S. J. Chem. Phys. 1955, 23, 1833.  

    21. [21]

      (21) Mulliken, R. S. J. Chem. Phys. 1955, 23, 2338.  (21) Mulliken, R. S. J. Chem. Phys. 1955, 23, 2338.  

    22. [22]

      (22) Bachrach, S. M. Population Analysis and Electron Densities from Quantum Mechanics. In Reviews in Computational Chemistry; Lipkowitz, K. B., Boyd, D. B. Eds.; VCH Publishers: New York, 1994; Vol. 5, pp 171-227.(22) Bachrach, S. M. Population Analysis and Electron Densities from Quantum Mechanics. In Reviews in Computational Chemistry; Lipkowitz, K. B., Boyd, D. B. Eds.; VCH Publishers: New York, 1994; Vol. 5, pp 171-227.

    23. [23]

      (23) Clark, A. E.; Sonnenberg, J. L.; Hay, P. J.; Martin, R. L. J. Chem. Phys. 2004, 121, 2563.  (23) Clark, A. E.; Sonnenberg, J. L.; Hay, P. J.; Martin, R. L. J. Chem. Phys. 2004, 121, 2563.  

    24. [24]

      (24) Martin, F.; Zipse, H. J. Comput. Chem. 2005, 26, 97.  (24) Martin, F.; Zipse, H. J. Comput. Chem. 2005, 26, 97.  

    25. [25]

      (25) Wiberg, K. B.; Rablen, P. R. J. Comput. Chem. 1993, 14, 1504.  (25) Wiberg, K. B.; Rablen, P. R. J. Comput. Chem. 1993, 14, 1504.  

    26. [26]

      (26) Lu, H. G.; Dai, D. D.; Yang, P.; Li, L. M. Phys. Chem. Chem. Phys. 2006, 8, 340.(26) Lu, H. G.; Dai, D. D.; Yang, P.; Li, L. M. Phys. Chem. Chem. Phys. 2006, 8, 340.

    27. [27]

      (27) Hirshfeld, F. L. Theor. Chem. Acc. 1977, 44, 129.  (27) Hirshfeld, F. L. Theor. Chem. Acc. 1977, 44, 129.  

    28. [28]

      (28) Lu, T.; Chen, F.W. J. Theor. Comput. Chem. Accepted.(28) Lu, T.; Chen, F.W. J. Theor. Comput. Chem. Accepted.

    29. [29]

      (29) Reed, A. E.;Weinstock, R. B.;Weinhold, F. J. Chem. Phys. 1985, 83, 735.  (29) Reed, A. E.;Weinstock, R. B.;Weinhold, F. J. Chem. Phys. 1985, 83, 735.  

    30. [30]

      (30) Besler, B. H.; Merz, K. M., Jr.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1990, 11, 431.  (30) Besler, B. H.; Merz, K. M., Jr.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1990, 11, 431.  

    31. [31]

      (31) Bader, R. F.W.; Beddall, P. M. J. Chem. Phys. 1972, 56, 3320.  (31) Bader, R. F.W.; Beddall, P. M. J. Chem. Phys. 1972, 56, 3320.  

    32. [32]

      (32) Halgren, T. A. J. Comput. Chem. 1996, 17, 520.  (32) Halgren, T. A. J. Comput. Chem. 1996, 17, 520.  

    33. [33]

      (33) Halgren, T. A. J. Comput. Chem. 1996, 17, 616.  (33) Halgren, T. A. J. Comput. Chem. 1996, 17, 616.  

    34. [34]

      (34) Jakalian, A.; Bush, B. L.; Jack, D. B.; Bayly, C. I. J. Comput. Chem. 2000, 21, 132.  (34) Jakalian, A.; Bush, B. L.; Jack, D. B.; Bayly, C. I. J. Comput. Chem. 2000, 21, 132.  

    35. [35]

      (35) Jakalian, A.; Jack, D. B.; Bayly, C. I. J. Comput. Chem. 2002, 23, 1623.  (35) Jakalian, A.; Jack, D. B.; Bayly, C. I. J. Comput. Chem. 2002, 23, 1623.  

    36. [36]

      (36) Gasteiger, J.; Marsili, M. Tetrahedron 1980, 36, 3219.  (36) Gasteiger, J.; Marsili, M. Tetrahedron 1980, 36, 3219.  

    37. [37]

      (37) Li, J. B.; Zhu, T. H.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 1820.  (37) Li, J. B.; Zhu, T. H.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 1820.  

    38. [38]

      (38) Rappe, A. K.; ddard,W. A. J. Phys. Chem. 1991, 95, 3358.  (38) Rappe, A. K.; ddard,W. A. J. Phys. Chem. 1991, 95, 3358.  

    39. [39]

      (39) Cusachs, L. C.; Politzer, P. Chem. Phys. Lett. 1968, 1, 529.  (39) Cusachs, L. C.; Politzer, P. Chem. Phys. Lett. 1968, 1, 529.  

    40. [40]

      (40) Stout, E.W.; Politzer, P. Theor. Chem. Acc. 1968, 12, 379.  (40) Stout, E.W.; Politzer, P. Theor. Chem. Acc. 1968, 12, 379.  

    41. [41]

      (41) Doggett, G. J. Chem. Soc. A 1969, 229.(41) Doggett, G. J. Chem. Soc. A 1969, 229.

    42. [42]

      (42) Christoffersena, R. E.; Baker, K. A. Chem. Phys. Lett. 1971, 8, 4.  (42) Christoffersena, R. E.; Baker, K. A. Chem. Phys. Lett. 1971, 8, 4.  

    43. [43]

      (43) Bickelhaupt, F. M.; van Eikema Hommes, N. J. R.; Fonseca Guerra, C.; Baerends, E. J. Organometallics 1996, 15, 2923.  (43) Bickelhaupt, F. M.; van Eikema Hommes, N. J. R.; Fonseca Guerra, C.; Baerends, E. J. Organometallics 1996, 15, 2923.  

    44. [44]

      (44) Weinhold, F. Natural Bond Orbital Methods. In Encyclopedia of Computational Chemistry; Schleyer, P. v. R. Ed.; JohnWiley & Sons:West Sussex, 1998; Vol. 2 pp 1792-1811.(44) Weinhold, F. Natural Bond Orbital Methods. In Encyclopedia of Computational Chemistry; Schleyer, P. v. R. Ed.; JohnWiley & Sons:West Sussex, 1998; Vol. 2 pp 1792-1811.

    45. [45]

      (45) Glendening, E. D.; Badenhoop, J. K.; Reed, A. E.; Carpenter, J. E.; Bohmann, J. A.; Morales, C. M.;Weinhold, F. NBO, Version 5.0, 2001. http://www.chem.wisc.edu/-nbo5/.(45) Glendening, E. D.; Badenhoop, J. K.; Reed, A. E.; Carpenter, J. E.; Bohmann, J. A.; Morales, C. M.;Weinhold, F. NBO, Version 5.0, 2001. http://www.chem.wisc.edu/-nbo5/.

    46. [46]

      (46) Liu,W.; Li, L. Theor. Chem. Acc. 1997, 95, 81.  (46) Liu,W.; Li, L. Theor. Chem. Acc. 1997, 95, 81.  

    47. [47]

      (47) Sanchez-Portal, D.; Artacho, E.; Soler, J. M. Solid State Commun. 1995, 95, 685.  (47) Sanchez-Portal, D.; Artacho, E.; Soler, J. M. Solid State Commun. 1995, 95, 685.  

    48. [48]

      (48) Sanchez-Portal, D.; Artacho, E.; Soler, J. M. J. Phys.: Condens. Matter 1996, 8, 3859.  (48) Sanchez-Portal, D.; Artacho, E.; Soler, J. M. J. Phys.: Condens. Matter 1996, 8, 3859.  

    49. [49]

      (49) Bader, F.W. Atoms in Molecules: A Quantum Theory; Oxford University Press: New York, 1994.(49) Bader, F.W. Atoms in Molecules: A Quantum Theory; Oxford University Press: New York, 1994.

    50. [50]

      (50) Nalewajski, R. F.; Parr, R. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2000, 97, 8879.  (50) Nalewajski, R. F.; Parr, R. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2000, 97, 8879.  

    51. [51]

      (51) Davidson, E. R.; Chakravorty, S. Theor. Chem. Acc. 1992, 83, 319.  (51) Davidson, E. R.; Chakravorty, S. Theor. Chem. Acc. 1992, 83, 319.  

    52. [52]

      (52) Chirlian, L. E.; Francl, M. M. J. Comput. Chem. 1987, 8, 894.  (52) Chirlian, L. E.; Francl, M. M. J. Comput. Chem. 1987, 8, 894.  

    53. [53]

      (53) Breneman, C. M.;Wiberg, K. B. J. Comput. Chem. 1990, 11, 361.  (53) Breneman, C. M.;Wiberg, K. B. J. Comput. Chem. 1990, 11, 361.  

    54. [54]

      (54) Sigfridsson, E.; Ryde, U. J. Comput. Chem. 1998, 19, 377.  (54) Sigfridsson, E.; Ryde, U. J. Comput. Chem. 1998, 19, 377.  

    55. [55]

      (55) Bayly, C. I.; Cieplak, P.; Cornell,W.; Kollman, P. A. J. Phys. Chem. 1993, 97, 10269.  (55) Bayly, C. I.; Cieplak, P.; Cornell,W.; Kollman, P. A. J. Phys. Chem. 1993, 97, 10269.  

    56. [56]

      (56) Dewar, M. J. S.; Zoebisch, E. G.; Healy, E. F.; Stewart, J. J. P. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 3902.  (56) Dewar, M. J. S.; Zoebisch, E. G.; Healy, E. F.; Stewart, J. J. P. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 3902.  

    57. [57]

      (57) Storer, J.W.; Giesen, D. J.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Comput. -Aided Mol. Des. 1995, 9, 87.  (57) Storer, J.W.; Giesen, D. J.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Comput. -Aided Mol. Des. 1995, 9, 87.  

    58. [58]

      (58) Li, J. B.;Williams, B.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Chem. Phys. 1999, 110, 724.  (58) Li, J. B.;Williams, B.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Chem. Phys. 1999, 110, 724.  

    59. [59]

      (59) Thompson, J. D.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Comput. Chem. 2003, 24, 1291.  (59) Thompson, J. D.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Comput. Chem. 2003, 24, 1291.  

    60. [60]

      (60) Winget, P.; Thompson, J. D.; Xidos, J. D.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 10707.  (60) Winget, P.; Thompson, J. D.; Xidos, J. D.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 10707.  

    61. [61]

      (61) Kalinowski, J. A.; Lesyng, B.; Thompson, J. D.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 2545.  (61) Kalinowski, J. A.; Lesyng, B.; Thompson, J. D.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 2545.  

    62. [62]

      (62) Olson, R. M.; Marenich, A. V.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Chem. Theory Comput. 2007, 3, 2046.  (62) Olson, R. M.; Marenich, A. V.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Chem. Theory Comput. 2007, 3, 2046.  

    63. [63]

      (63) Kelly, C. P.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Chem. Theory Comput. 2005, 1, 1133.  (63) Kelly, C. P.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Chem. Theory Comput. 2005, 1, 1133.  

    64. [64]

      (64) Mayer, I. Chem. Phys. Lett. 1983, 97, 270.  (64) Mayer, I. Chem. Phys. Lett. 1983, 97, 270.  

    65. [65]

      (65) Sanderson, R. T. Science 1951, 114, 670.  (65) Sanderson, R. T. Science 1951, 114, 670.  

    66. [66]

      (66) Rappe, A. K.; Casewit, C. J.; Colwell, K. S.; ddard,W. A.; Skiff,W. M. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 10024.  (66) Rappe, A. K.; Casewit, C. J.; Colwell, K. S.; ddard,W. A.; Skiff,W. M. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 10024.  

    67. [67]

      (67) Mortier,W. J.; Ghosh, S. K.; Shankar, S. J. Am. Chem. Soc. 1986, 108, 4315.  (67) Mortier,W. J.; Ghosh, S. K.; Shankar, S. J. Am. Chem. Soc. 1986, 108, 4315.  

    68. [68]

      (68) Cioslowski, J. Phys. Rev. Lett. 1989, 62, 1469.  (68) Cioslowski, J. Phys. Rev. Lett. 1989, 62, 1469.  

    69. [69]

      (69) Cioslowski, J. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 8333.  (69) Cioslowski, J. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 8333.  

    70. [70]

      (70) Szabo, A.; Ostlund, N. S. Modern Quantum Chemistry, 1st rev ed.; Dover Publications: New York, 1989.(70) Szabo, A.; Ostlund, N. S. Modern Quantum Chemistry, 1st rev ed.; Dover Publications: New York, 1989.

    71. [71]

      (71) Hariharan, P. C.; Pople, J. A. Theor. Chem. Acc. 1973, 28, 213.  (71) Hariharan, P. C.; Pople, J. A. Theor. Chem. Acc. 1973, 28, 213.  

    72. [72]

      (72) Hehre,W. J.; Ditchfield, R.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1972, 56, 2257.  (72) Hehre,W. J.; Ditchfield, R.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1972, 56, 2257.  

    73. [73]

      (73) Frisch, M. J.; Pople, J. A.; Binkley, J. S. J. Chem. Phys. 1984, 80, 3265.  (73) Frisch, M. J.; Pople, J. A.; Binkley, J. S. J. Chem. Phys. 1984, 80, 3265.  

    74. [74]

      (74) Frisch, M. J.; Trucks, G.W.; Schlegel, H. B.; et al . Gaussian 03, Revison E.01; Gaussian Inc.:Wallingford, CT, 2004.(74) Frisch, M. J.; Trucks, G.W.; Schlegel, H. B.; et al . Gaussian 03, Revison E.01; Gaussian Inc.:Wallingford, CT, 2004.

    75. [75]

      (75) Lu, T. Multiwfn, Version 2.1.2; 2011. http://Multiwfn.codeplex. com.(75) Lu, T. Multiwfn, Version 2.1.2; 2011. http://Multiwfn.codeplex. com.

    76. [76]

      (76) Keith, T. A. AIMALL, Version 10.05.04, 2010.(76) Keith, T. A. AIMALL, Version 10.05.04, 2010.

    77. [77]

      (77) Lu, H. G. AOIM, Version 1.1, 2006; http://faculty.sxu.cn/luhg/ aoim.html.(77) Lu, H. G. AOIM, Version 1.1, 2006; http://faculty.sxu.cn/luhg/ aoim.html.

    78. [78]

      (78) Avogadro: an Open-Source Molecular Builder and Visualization Tool, Version 1.0.3, 2011.(78) Avogadro: an Open-Source Molecular Builder and Visualization Tool, Version 1.0.3, 2011.

    79. [79]

      (79) Case, D. A.; Darden, T. A.; Cheatham, T. E. C. III., et al . AmberTools, Version 1.5; 2011.(79) Case, D. A.; Darden, T. A.; Cheatham, T. E. C. III., et al . AmberTools, Version 1.5; 2011.

    80. [80]

      (80) Schäfer, A.; Horn, H.; Ahlrichs, R. J. Chem. Phys. 1992, 97, 2571.  (80) Schäfer, A.; Horn, H.; Ahlrichs, R. J. Chem. Phys. 1992, 97, 2571.  

    81. [81]

      (81) PETRA Manual. http://www2.ccc.uni-erlangen.de/software/ petra/manual (accessed Sep 12, 2011).(81) PETRA Manual. http://www2.ccc.uni-erlangen.de/software/ petra/manual (accessed Sep 12, 2011).

    82. [82]

      (82) Marsili, M.; Gasteiger, J. Croat. Chem. Acta 1980, 53, 601.(82) Marsili, M.; Gasteiger, J. Croat. Chem. Acta 1980, 53, 601.

    83. [83]

      (83) The Open Babel Package, Version 2.3.0; 2010. http://openbabel. sourceforge.net.(83) The Open Babel Package, Version 2.3.0; 2010. http://openbabel. sourceforge.net.

    84. [84]

      (84) Sanner, M. F. J. Mol. Graph. Modal. 1999, 17, 57.(84) Sanner, M. F. J. Mol. Graph. Modal. 1999, 17, 57.

    85. [85]

      (85) Woods, R. J.; Khalil, M.; Pell,W.; Moffat, S. H.; Smith, V. H. J. Comput. Chem. 1990, 11, 297.  (85) Woods, R. J.; Khalil, M.; Pell,W.; Moffat, S. H.; Smith, V. H. J. Comput. Chem. 1990, 11, 297.  

    86. [86]

      (86) Hehre,W. J.; Stewart, R. F.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1969, 51, 2657.  (86) Hehre,W. J.; Stewart, R. F.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1969, 51, 2657.  

    87. [87]

      (87) Binkley, J. S.; Pople, J. A.; Hehre,W. J. J. Am. Chem. Soc. 1980, 102, 939.  (87) Binkley, J. S.; Pople, J. A.; Hehre,W. J. J. Am. Chem. Soc. 1980, 102, 939.  

    88. [88]

      (88) Krishnan, R.; Binkley, J. S.; Seeger, R.; Pople, J. A. J. Chern. Phys. 1980, 72, 650.  (88) Krishnan, R.; Binkley, J. S.; Seeger, R.; Pople, J. A. J. Chern. Phys. 1980, 72, 650.  

    89. [89]

      (89) Dunning, J. T. H. J. Chem. Phys. 1989, 90, 1007.  (89) Dunning, J. T. H. J. Chem. Phys. 1989, 90, 1007.  

    90. [90]

      (90) Kendall, R. A.; Dunning, T. H.; Harrison, R. J. J. Chem. Phys. 1992, 96, 6796.  (90) Kendall, R. A.; Dunning, T. H.; Harrison, R. J. J. Chem. Phys. 1992, 96, 6796.  

    91. [91]

      (91) Becke, A. D. Phys. Rev. A 1988, 38, 3098.  (91) Becke, A. D. Phys. Rev. A 1988, 38, 3098.  

    92. [92]

      (92) Perdew, J. P. Phys. Rev. B 1986, 33, 8822.  (92) Perdew, J. P. Phys. Rev. B 1986, 33, 8822.  

    93. [93]

      (93) Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 1372.  (93) Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 1372.  

    94. [94]

      (94) Patel, S.; Brooks, C. L. Mol. Simul. 2006, 32, 231.  (94) Patel, S.; Brooks, C. L. Mol. Simul. 2006, 32, 231.  

    95. [95]

      (95) Stewart, J. J. P. Int. J. Quantum Chem. 1996, 58, 133.  (95) Stewart, J. J. P. Int. J. Quantum Chem. 1996, 58, 133.  

    96. [96]

      (96) Biegler-König, F.W. J. Comput. Chem. 2000, 21, 1040.  (96) Biegler-König, F.W. J. Comput. Chem. 2000, 21, 1040.  

    97. [97]

      (97) Biegler-König, F.W.; Bader, R. F.W.; Tang, T. H. J. Comput. Chem. 1982, 3, 317.  (97) Biegler-König, F.W.; Bader, R. F.W.; Tang, T. H. J. Comput. Chem. 1982, 3, 317.  

    98. [98]

      (98) Sanville, E.; Kenny, S. D.; Smith, R.; Henkelman, G. J. Comput. Chem. 2007, 28, 899.  (98) Sanville, E.; Kenny, S. D.; Smith, R.; Henkelman, G. J. Comput. Chem. 2007, 28, 899.  

    99. [99]

      (99) Maseras, F.; Morokuma, K. Chem. Phys. Lett. 1992, 195, 500.  (99) Maseras, F.; Morokuma, K. Chem. Phys. Lett. 1992, 195, 500.  

  • 加载中
计量
  • PDF下载量:  3141
  • 文章访问数:  7029
  • HTML全文浏览量:  459
文章相关
  • 发布日期:  2011-12-29
  • 收稿日期:  2011-09-13
  • 网络出版日期:  2011-10-31
通讯作者: 陈斌, bchen63@163.com
  • 1. 

    沈阳化工大学材料科学与工程学院 沈阳 110142

  1. 本站搜索
  2. 百度学术搜索
  3. 万方数据库搜索
  4. CNKI搜索

/

返回文章