注册 English

左苯丙胺在多巴胺第三受体分子通道中传输分子动力学模拟

谢炜 ,  徐泽人 ,  王明 ,  徐四川

downloadPDF
引用本文: 谢炜, 徐泽人, 王明, 徐四川. 左苯丙胺在多巴胺第三受体分子通道中传输分子动力学模拟[J]. 物理化学学报, 2016, 32(4): 907-920. doi: 10.3866/PKU.WHXB201601141 shu
Citation:  XIE Wei, XU Ze-Ren, WANG Ming, XU Si-Chuan. Molecular Dynamics Simulation for Levo-Benzedrine to Transmit through Molecular Channels within D3R[J]. Acta Physico-Chimica Sinica, 2016, 32(4): 907-920. doi: 10.3866/PKU.WHXB201601141 shu

左苯丙胺在多巴胺第三受体分子通道中传输分子动力学模拟

  • 1.

    云南大学化学科学与工程学院, 自然资源药物化学教育部重点实验室, 昆明 650091

    • 通讯作者: 徐四川
  • 基金项目:

    国家自然科学基金(21163024, 21563032)资助项目 (21163024, 21563032)

摘要: 左旋苯丙胺(又称左苯丙胺,RAT)在临床上被用于治疗多种病症,作用在中枢神经细胞多巴胺受体上,同时它具有依赖性和成瘾性。为了探讨RAT被用作药物的药理和成瘾机制,本文用分子模拟获得RAT与多巴胺第三受体(D3R)复合蛋白优化结构,并且采用伞形样本平均力势(PMF)方法和卵磷脂脂质分子模拟生物膜,采用分子动力学模拟获得RAT在D3R结构中分子通道运动轨迹和自由能变化。RAT通过D3R结构中的功能分子通道,朝细胞外方向传输运动的自由能变化为91.4 kJ·mol-1。RAT通过D3R结构中的保护分子通道,朝细胞双层膜方向传输运动的自由能变化为117.7 kJ·mol-1。自由能数值表明RAT分子更容易通过D3R结构中的功能分子通道,发挥其功能作用,增大功能多巴胺分子的释放,导致包括依赖性和成瘾性多种功能效果。研究结果证明RAT被用作药物的药理和成瘾机制与它在多巴胺受体中的分子通道上传输动力学和机制有密切关联。

English

    1. [1]

      (1) Bunzow, J. R.; Van Tol, H. H. M.; Grandy, D. K.; Albert, P.; Salon, J.; Christie, M. Nature 1988, 336, 783. doi: 10.1038/336783a0(1) Bunzow, J. R.; Van Tol, H. H. M.; Grandy, D. K.; Albert, P.; Salon, J.; Christie, M. Nature 1988, 336, 783. doi: 10.1038/336783a0

    2. [2]

      (2) Dearry, A.; Gingrich, J. A.; Falardeau, P.; Fremeau, R. T.; Bates, M. D.; Caron, M. G. Nature 1990, 347, 72. doi: 10.1038/347072a0(2) Dearry, A.; Gingrich, J. A.; Falardeau, P.; Fremeau, R. T.; Bates, M. D.; Caron, M. G. Nature 1990, 347, 72. doi: 10.1038/347072a0

    3. [3]

      (3) Sokoloff, P.; Giros, B.; Martres, M. P.; Bouthenet, M. L.; Schwartz, J. C. Nature 1990, 347, 146. doi: 10.1038/347146a0(3) Sokoloff, P.; Giros, B.; Martres, M. P.; Bouthenet, M. L.; Schwartz, J. C. Nature 1990, 347, 146. doi: 10.1038/347146a0

    4. [4]

      (4) Van Tol, H. H.; Bunzow, J. R.; Guan, H. C.; Sunahara, R. K.; Seeman, P.; Niznik, H. B.; Civelli, O. Nature 1991, 350, 610. doi: 10.1038/350610a0(4) Van Tol, H. H.; Bunzow, J. R.; Guan, H. C.; Sunahara, R. K.; Seeman, P.; Niznik, H. B.; Civelli, O. Nature 1991, 350, 610. doi: 10.1038/350610a0

    5. [5]

      (5) Sunahara, R. K.; Guan, H. C.; O'Dowd, B. F.; Seeman, P.; Laurier, L. G.; Ng, G.; George, S. R.; Torchia, J.; Van Tol, H. H.; Niznik, H. B. Nature 1991, 350, 614. doi: 10.1038/350614a0(5) Sunahara, R. K.; Guan, H. C.; O'Dowd, B. F.; Seeman, P.; Laurier, L. G.; Ng, G.; George, S. R.; Torchia, J.; Van Tol, H. H.; Niznik, H. B. Nature 1991, 350, 614. doi: 10.1038/350614a0

    6. [6]

      (6) Kebabian, J.W.; Calne, D. B. Nature 1979, 277 (5692), 93. doi: 10.1038/277093a0(6) Kebabian, J.W.; Calne, D. B. Nature 1979, 277 (5692), 93. doi: 10.1038/277093a0

    7. [7]

      (7) Xu, M.; Koeltzo, T. E.; Santiago, G. T.; Moratalla, R.; Cooper, D. C.; Hu, X. T.; White, N. M.; Graybiel, A. M.; White, F. J.; Tonegawa, S. Neuron 1997, 19 (4), 837. doi: 10.1016/S0896-6273(00)80965-4(7) Xu, M.; Koeltzo, T. E.; Santiago, G. T.; Moratalla, R.; Cooper, D. C.; Hu, X. T.; White, N. M.; Graybiel, A. M.; White, F. J.; Tonegawa, S. Neuron 1997, 19 (4), 837. doi: 10.1016/S0896-6273(00)80965-4

    8. [8]

      (8) Bontempi, B.; Sharp, F. R. J. Neurosci. 1997, 17, 8596.(8) Bontempi, B.; Sharp, F. R. J. Neurosci. 1997, 17, 8596.

    9. [9]

      (9) Plante-Bordeneuve, V.; Taussig, D.; Thomas, F.; Said, G.; Wood, N.W.; Marsden, C. D. Neurology 1997, 48, 1589. doi: 10.1212/WNL.48.6.1589(9) Plante-Bordeneuve, V.; Taussig, D.; Thomas, F.; Said, G.; Wood, N.W.; Marsden, C. D. Neurology 1997, 48, 1589. doi: 10.1212/WNL.48.6.1589

    10. [10]

      (10) Li, F.; Shu, S. Y.; Bao, X. M. Chinese Journal of Neuroscience 2003, 19 (6), 405. [李凡, 舒斯云, 包新民. 中国神经科学杂志, 2003, 19 (6), 405.](10) Li, F.; Shu, S. Y.; Bao, X. M. Chinese Journal of Neuroscience 2003, 19 (6), 405. [李凡, 舒斯云, 包新民. 中国神经科学杂志, 2003, 19 (6), 405.]

    11. [11]

      (11) Carlsson, A.;Waters, N.;Waters, S.; Carlsson, M. L. Brain Research Reviews 2000, 31, 342. doi: 10.1016/S0165-0173(99)00050-8(11) Carlsson, A.;Waters, N.;Waters, S.; Carlsson, M. L. Brain Research Reviews 2000, 31, 342. doi: 10.1016/S0165-0173(99)00050-8

    12. [12]

      (12) Suri, R. E.; Bargas, J.; Arbib, M, A. Neuroscience 2001, 103, 65. doi: 10.1016/S0306-4522(00)00554-6(12) Suri, R. E.; Bargas, J.; Arbib, M, A. Neuroscience 2001, 103, 65. doi: 10.1016/S0306-4522(00)00554-6

    13. [13]

      (13) Salum, C.; Roque, S. A.; Pickering, A. Neurocomputing 1999, 26-27, 845. doi: 10.1016/S0925-2312(98)00129-5(13) Salum, C.; Roque, S. A.; Pickering, A. Neurocomputing 1999, 26-27, 845. doi: 10.1016/S0925-2312(98)00129-5

    14. [14]

      (14) Xu, S. C.; Shi, G. J.; Chi, S. M. The Active Site Residues and the Molecular Channels for Dopamine within D3R Membrane Protein. The 28thCCS (Chinese Chemical Society) Congress, Sichuan University, Chengdu, China, April 13-16, 2012.(14) Xu, S. C.; Shi, G. J.; Chi, S. M. The Active Site Residues and the Molecular Channels for Dopamine within D3R Membrane Protein. The 28thCCS (Chinese Chemical Society) Congress, Sichuan University, Chengdu, China, April 13-16, 2012.

    15. [15]

      (15) Bian, F. Y.; Shi, G. J.; Chi, S. M.; Xu, S. C. The Perspective Insight into the Pathology of Parkinsonism Using the Molecular Channel Theory of Dopamine inside its Receptor Membrane Protein. Chinese Chemical Society at the Second National Conference on Bio-physical Chemistry (NCBPC2) and the International Forum on Development of Chinese Bio-physical Chemistry, Wuhan University, Wuhan, China, Oct 15-18, 2012.(15) Bian, F. Y.; Shi, G. J.; Chi, S. M.; Xu, S. C. The Perspective Insight into the Pathology of Parkinsonism Using the Molecular Channel Theory of Dopamine inside its Receptor Membrane Protein. Chinese Chemical Society at the Second National Conference on Bio-physical Chemistry (NCBPC2) and the International Forum on Development of Chinese Bio-physical Chemistry, Wuhan University, Wuhan, China, Oct 15-18, 2012.

    16. [16]

      (16) Zhang, J.W.; Bian, F. Y.; Shi, G. J.; Xu, S. C. Acta Phys. -Chim. Sin. 2014, 30, 183. [张继伟, 卞富永, 施国军, 徐四川. 物理化学学报, 2014, 30, 183.] doi: 10.3866/PKU.WHXB201311281(16) Zhang, J.W.; Bian, F. Y.; Shi, G. J.; Xu, S. C. Acta Phys. -Chim. Sin. 2014, 30, 183. [张继伟, 卞富永, 施国军, 徐四川. 物理化学学报, 2014, 30, 183.] doi: 10.3866/PKU.WHXB201311281

    17. [17]

      (17) Chien, E. Y. T.; Liu, W.; Zhao, Q.; Katritch, V.; Han, G.W.; Hanson, M. A.; Shi, L.; Newman, A. H.; Javitch, J. A.; Cherezov, V.; Stevens, R. C. Science 2010, 330, 1091. doi: 10.1126/science.1197410(17) Chien, E. Y. T.; Liu, W.; Zhao, Q.; Katritch, V.; Han, G.W.; Hanson, M. A.; Shi, L.; Newman, A. H.; Javitch, J. A.; Cherezov, V.; Stevens, R. C. Science 2010, 330, 1091. doi: 10.1126/science.1197410

    18. [18]

      (18) Roth, C. B.; Hanson, M. A.; Stevens, R. C. J. Mol. Biol. 2008, 376, 1305. doi: 10.1016/j.jmb.2007.12.028(18) Roth, C. B.; Hanson, M. A.; Stevens, R. C. J. Mol. Biol. 2008, 376, 1305. doi: 10.1016/j.jmb.2007.12.028

    19. [19]

      (19) Rosenbaum, D. M.; Cherezov, V.; Hanson, M. A.; Rasmussen, S. G.; Thian, F. S.; Kobilka, T. S.; Choi, H. J.; Yao, X. J.;Weis, W. I.; Stevens, R. C.; Kobilka, B. K. Science 2007, 318, 1266. doi: 10.1126/science.1150609(19) Rosenbaum, D. M.; Cherezov, V.; Hanson, M. A.; Rasmussen, S. G.; Thian, F. S.; Kobilka, T. S.; Choi, H. J.; Yao, X. J.;Weis, W. I.; Stevens, R. C.; Kobilka, B. K. Science 2007, 318, 1266. doi: 10.1126/science.1150609

    20. [20]

      (20) DePaulis, T.; Hall, H.; Ogren, S. Eur. J. Med. Chem. Chim. Ther. 1985, 20, 273.(20) DePaulis, T.; Hall, H.; Ogren, S. Eur. J. Med. Chem. Chim. Ther. 1985, 20, 273.

    21. [21]

      (21) Griffon, N.; Pilon, C.; Sautel, F.; Schwartz, J. C.; Sokoloff, P. J. Neural. Transm. 1996, 103, 1163. doi: 10.1007/BF01271201(21) Griffon, N.; Pilon, C.; Sautel, F.; Schwartz, J. C.; Sokoloff, P. J. Neural. Transm. 1996, 103, 1163. doi: 10.1007/BF01271201

    22. [22]

      (22) Jin, Y.;Wang, Y.; Bian, F. Y.; Shi, Q.; Ge, M. F.;Wang, S.; Zhang, X. K.; Xu, S. C. Acta Phys. -Chim. Sin. 2011, 27, 2432. [金毅, 王悦, 卞富永, 史强, 葛茂发, 王树, 张兴康, 徐四川. 物理化学学报, 2011, 27, 2432.] doi: 10.3866/PKU.WHXB20111001(22) Jin, Y.;Wang, Y.; Bian, F. Y.; Shi, Q.; Ge, M. F.;Wang, S.; Zhang, X. K.; Xu, S. C. Acta Phys. -Chim. Sin. 2011, 27, 2432. [金毅, 王悦, 卞富永, 史强, 葛茂发, 王树, 张兴康, 徐四川. 物理化学学报, 2011, 27, 2432.] doi: 10.3866/PKU.WHXB20111001

    23. [23]

      (23) Hoff, B.; Strandberg, E.; Ulrich, A. S.; Tieleman, D. P.; Posten, C. Biophys. J. 2005, 88, 1818. doi: 10.1529/biophysj.104.052399(23) Hoff, B.; Strandberg, E.; Ulrich, A. S.; Tieleman, D. P.; Posten, C. Biophys. J. 2005, 88, 1818. doi: 10.1529/biophysj.104.052399

    24. [24]

      (24) Janosi, L.; Gorfe, A. A. J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 3267. doi: 10.1021/ct100381g(24) Janosi, L.; Gorfe, A. A. J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 3267. doi: 10.1021/ct100381g

    25. [25]

      (25) Su, Z. Y.;Wang, Y. T. J. Phys. Chem. B 2011, 115, 796. doi: 10.1021/jp107599v(25) Su, Z. Y.;Wang, Y. T. J. Phys. Chem. B 2011, 115, 796. doi: 10.1021/jp107599v

    26. [26]

      (26) Dunkin, C. M.; Pokorny, A.; Almeida, P. F.; Lee, H. S. J. Phys. Chem. B 2011, 115, 1188. doi: 10.1021/jp107763b(26) Dunkin, C. M.; Pokorny, A.; Almeida, P. F.; Lee, H. S. J. Phys. Chem. B 2011, 115, 1188. doi: 10.1021/jp107763b

    27. [27]

      (27) Chen, R.; Poger, D.; Mark, A. E. J. Phys. Chem. B 2011, 115, 1038. doi: 10.1021/jp110002q(27) Chen, R.; Poger, D.; Mark, A. E. J. Phys. Chem. B 2011, 115, 1038. doi: 10.1021/jp110002q

    28. [28]

      (28) Merlino, A.; Vitiello, G.; Grimaldi, M.; Sica, F.; Busi, E.; Basosi, R.; D'Ursi, A. M.; Fragneto, G.; Paduano, L.; D'Errico, G. J. Phys. Chem. B 2012, 116, 401. doi: 10.1021/jp204781a(28) Merlino, A.; Vitiello, G.; Grimaldi, M.; Sica, F.; Busi, E.; Basosi, R.; D'Ursi, A. M.; Fragneto, G.; Paduano, L.; D'Errico, G. J. Phys. Chem. B 2012, 116, 401. doi: 10.1021/jp204781a

    29. [29]

      (29) Yamamoto, E.; Akimoto, T.; Shimizu, H.; Hirano, Y.; Yasui, M.; Yasuoka, K. J. Phys. Chem. B 2012, 116, 8989. doi: 10.1021/jp303330c(29) Yamamoto, E.; Akimoto, T.; Shimizu, H.; Hirano, Y.; Yasui, M.; Yasuoka, K. J. Phys. Chem. B 2012, 116, 8989. doi: 10.1021/jp303330c

    30. [30]

      (30) Polyansky, A. A.; Volynsky, P. E.; Nolde, D. E.; Arseniev, A. S.; Efremov, R. G. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 15052. doi: 10.1021/jp0510185(30) Polyansky, A. A.; Volynsky, P. E.; Nolde, D. E.; Arseniev, A. S.; Efremov, R. G. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 15052. doi: 10.1021/jp0510185

    31. [31]

      (31) Puri, A.; Jang, H.; Yavlovich, A.; Masood, M. A.; Veenstra, T. D.; Luna, C.; Aranda-Espinoza, H.; Nussinov, R.; Blumenthal, R. Langmuir 2011, 27, 15120. doi: 10.1021/la203453x(31) Puri, A.; Jang, H.; Yavlovich, A.; Masood, M. A.; Veenstra, T. D.; Luna, C.; Aranda-Espinoza, H.; Nussinov, R.; Blumenthal, R. Langmuir 2011, 27, 15120. doi: 10.1021/la203453x

    32. [32]

      (32) Manna, M.; Mukhopadhyay, C. Langmuir 2009, 25, 12235. doi: 10.1021/la902660q(32) Manna, M.; Mukhopadhyay, C. Langmuir 2009, 25, 12235. doi: 10.1021/la902660q

    33. [33]

      (33) Hartshorn, M.; Jewett, C. M.; Brozik, J. A. Langmuir 2010, 26, 2609. doi: 10.1021/la904308g(33) Hartshorn, M.; Jewett, C. M.; Brozik, J. A. Langmuir 2010, 26, 2609. doi: 10.1021/la904308g

    34. [34]

      (34) Mondal, S.; Mukhopadhyay, C. Langmuir 2008, 24, 10298. doi: 10.1021/la8015589(34) Mondal, S.; Mukhopadhyay, C. Langmuir 2008, 24, 10298. doi: 10.1021/la8015589

    35. [35]

      (35) Soemo, A. R.;Wirth, M. J. Langmuir 2010, 26, 2196. doi: 10.1021/la9038914(35) Soemo, A. R.;Wirth, M. J. Langmuir 2010, 26, 2196. doi: 10.1021/la9038914

    36. [36]

      (36) Payandeh, J.; Gamal El-Din, T. M.; Scheuer, T.; Zheng, N.; Catterall, W. A. Nature 2012, 486, 135. doi: 10.1038/nature11077(36) Payandeh, J.; Gamal El-Din, T. M.; Scheuer, T.; Zheng, N.; Catterall, W. A. Nature 2012, 486, 135. doi: 10.1038/nature11077

    37. [37]

      (37) Jönsson, P.; Jonsson, M. P.; Höök, F. Nano Lett. 2010, 10, 1900. doi: 10.1021/nl100779k(37) Jönsson, P.; Jonsson, M. P.; Höök, F. Nano Lett. 2010, 10, 1900. doi: 10.1021/nl100779k

    38. [38]

      (38) Carr, R.;Weinstock, I. A.; Sivaprasadarao, A.; Müller, A.; Aksimentiev, A. Nano Lett. 2008, 8, 3916. doi: 10.1021/nl802366k(38) Carr, R.;Weinstock, I. A.; Sivaprasadarao, A.; Müller, A.; Aksimentiev, A. Nano Lett. 2008, 8, 3916. doi: 10.1021/nl802366k

    39. [39]

      (39) Marrink, S. J.; Lindahl, E.; Edholm, O.; Mark, A. E. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123 (35), 8638. doi: 10.1021/ja0159618(39) Marrink, S. J.; Lindahl, E.; Edholm, O.; Mark, A. E. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123 (35), 8638. doi: 10.1021/ja0159618

    40. [40]

      (40) Miyamoto, S.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1992, 13, 952. doi: 10.1002/jcc.540130805(40) Miyamoto, S.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1992, 13, 952. doi: 10.1002/jcc.540130805

    41. [41]

      (41) Frisch, M. J.; Trucks, G.W.; Schlegel, H. B.; et al. Gaussian 03, Revison B.01; Gaussian Inc.: Pittsburgh PA, 2003.(41) Frisch, M. J.; Trucks, G.W.; Schlegel, H. B.; et al. Gaussian 03, Revison B.01; Gaussian Inc.: Pittsburgh PA, 2003.

    42. [42]

      (42) Lang, P. T.; Moustakas, D.; Brozell, S.; Carrascal, N.; Mukherjee, S.; Pegg, S.; Kuntz, I. DOCK 6.1; University of California: San Francisco, 2006.(42) Lang, P. T.; Moustakas, D.; Brozell, S.; Carrascal, N.; Mukherjee, S.; Pegg, S.; Kuntz, I. DOCK 6.1; University of California: San Francisco, 2006.

    43. [43]

      (43) Shi, G. J.;Wang, Y.; Jin, Y.; Chi, S. M.; Shi, Q.; Ge, M. F; Zhang, X. K.; Xu, S. C. J. Biomol. Struct. Dyn. 2012, 30 (5), 559. doi: 10.1080/07391102.2012.687522(43) Shi, G. J.;Wang, Y.; Jin, Y.; Chi, S. M.; Shi, Q.; Ge, M. F; Zhang, X. K.; Xu, S. C. J. Biomol. Struct. Dyn. 2012, 30 (5), 559. doi: 10.1080/07391102.2012.687522

    44. [44]

      (44) Wang, Y.; Bian, F. Y.; Deng, S. R.; Shi, Q.; Ge, M. F.;Wang, S.; Zhang, X. K.; Xu, S. C. J. Biomol. Struct. Dyn. 2011, 28 (6), 881. doi: 10.1080/07391102.2011.10508615(44) Wang, Y.; Bian, F. Y.; Deng, S. R.; Shi, Q.; Ge, M. F.;Wang, S.; Zhang, X. K.; Xu, S. C. J. Biomol. Struct. Dyn. 2011, 28 (6), 881. doi: 10.1080/07391102.2011.10508615

    45. [45]

      (45) Xu, S. C.; Chi, S. M.; Jin, Y.; Shi, Q.; Ge, M. F.;Wang, S.; Zhang, X. K. J. Mol. Model. 2012, 18 (1), 377. doi: 10.1007/s00894-011-1083-7(45) Xu, S. C.; Chi, S. M.; Jin, Y.; Shi, Q.; Ge, M. F.;Wang, S.; Zhang, X. K. J. Mol. Model. 2012, 18 (1), 377. doi: 10.1007/s00894-011-1083-7

    46. [46]

      (46) Chi, S.; Xie, W.; Zhang, J.; Xu, S. C. J. Biomol. Struct. Dyn. 2015, 33 (10), 2234. doi: 10.1080/07391102.2014.999256(46) Chi, S.; Xie, W.; Zhang, J.; Xu, S. C. J. Biomol. Struct. Dyn. 2015, 33 (10), 2234. doi: 10.1080/07391102.2014.999256

    47. [47]

      (47) Berendsen, H. J. C.; van der Spoel, D.; van Drunen, R. Computer Physics Communications 1995, 91, 43. doi: 10.1016/0010-4655(95)00042-E(47) Berendsen, H. J. C.; van der Spoel, D.; van Drunen, R. Computer Physics Communications 1995, 91, 43. doi: 10.1016/0010-4655(95)00042-E

    48. [48]

      (48) Van der Spoel, D.; Lindahl, E.; Hess, B.; Groenhof, G.; Mark, A. E.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Chem. 2005, 26, 1701. doi: 10.1002/jcc.20291(48) Van der Spoel, D.; Lindahl, E.; Hess, B.; Groenhof, G.; Mark, A. E.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Chem. 2005, 26, 1701. doi: 10.1002/jcc.20291

    49. [49]

      (49) Hub, J. S.; de Groot, B. L.; Grubmüller, H.; Groenhof, G. J. Chem. Theory Comput. 2014, 10, 381. doi: 10.1021/ct400626b(49) Hub, J. S.; de Groot, B. L.; Grubmüller, H.; Groenhof, G. J. Chem. Theory Comput. 2014, 10, 381. doi: 10.1021/ct400626b

    50. [50]

      (50) Humphrey, W.; Dalke, A.; Schulten, K. J. Mol. Graph. Model. 1996, 14, 33. doi: 10.1016/0263-7855(96)00018-5(50) Humphrey, W.; Dalke, A.; Schulten, K. J. Mol. Graph. Model. 1996, 14, 33. doi: 10.1016/0263-7855(96)00018-5

    51. [51]

      (51) Xu, S. C.; Deng, S. R.; Ma, L. Y.; Shi, Q.; Ge, M. F.; Zhang, X. K. Acta Phys. -Chim. Sin. 2009, 25, 1290. [徐四川, 邓圣荣, 马丽英, 史强, 葛茂发, 张兴康. 物理化学学报, 2009, 25, 1290.] doi: 10.3866/PKU.WHXB20090701(51) Xu, S. C.; Deng, S. R.; Ma, L. Y.; Shi, Q.; Ge, M. F.; Zhang, X. K. Acta Phys. -Chim. Sin. 2009, 25, 1290. [徐四川, 邓圣荣, 马丽英, 史强, 葛茂发, 张兴康. 物理化学学报, 2009, 25, 1290.] doi: 10.3866/PKU.WHXB20090701

    52. [52]

      (52) Daura, X.; Mark, A. E.; Van Gunsteren, W. F. J. Comput. Chem. 1998, 19 (5), 535. doi: 10.1002/(SICI)1096-987X (19980415)19:5<535::AID-JCC6>3.0.CO;2-N(52) Daura, X.; Mark, A. E.; Van Gunsteren, W. F. J. Comput. Chem. 1998, 19 (5), 535. doi: 10.1002/(SICI)1096-987X (19980415)19:5<535::AID-JCC6>3.0.CO;2-N

    53. [53]

      (53) Van Gunsteren, W.; Billeter, S.; Eising, A.; Hunenberger, P.; Kruger, P.; Mark, A.; Tironi, I. Biomolecular Simulation: the Gromos 96 Manual and User Guide, 1st ed.; Hochschulverlag AG an der ETH Zurich: Zurich, Switzerland, 1996.(53) Van Gunsteren, W.; Billeter, S.; Eising, A.; Hunenberger, P.; Kruger, P.; Mark, A.; Tironi, I. Biomolecular Simulation: the Gromos 96 Manual and User Guide, 1st ed.; Hochschulverlag AG an der ETH Zurich: Zurich, Switzerland, 1996.

    54. [54]

      (54) Hess, B.; Kutzner, C.; van der Spoel, D.; Lindahl, E. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 435. doi: 10.1021/ct700301q(54) Hess, B.; Kutzner, C.; van der Spoel, D.; Lindahl, E. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 435. doi: 10.1021/ct700301q

    55. [55]

      (55) Bian, F. Y.; Zhang, J.W.;Wang, D.; Xu, S. C. Acta Phys. -Chim. Sin. 2014, 30, 1947. [卞富永, 张继伟, 王丹, 徐四川. 物理化学学报, 2014, 30, 1947.] doi: 10.3866/PKU.WHXB201408271(55) Bian, F. Y.; Zhang, J.W.;Wang, D.; Xu, S. C. Acta Phys. -Chim. Sin. 2014, 30, 1947. [卞富永, 张继伟, 王丹, 徐四川. 物理化学学报, 2014, 30, 1947.] doi: 10.3866/PKU.WHXB201408271

    56. [56]

      (56) Van der Spoel, D.; Lindahl, E.; Hess, B.; van Buuren, A. R.; Apol, E.; Meulenhoff, P. J.; Berendsen, H. J. Gromacs User Manual, version 4.5; www.gromacs.org, 2013.(56) Van der Spoel, D.; Lindahl, E.; Hess, B.; van Buuren, A. R.; Apol, E.; Meulenhoff, P. J.; Berendsen, H. J. Gromacs User Manual, version 4.5; www.gromacs.org, 2013.

    57. [57]

      (57) Hub, J. S.; de Groot, B. L.; van der Spoel, D. J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 3713. doi: 10.1021/ct100494z(57) Hub, J. S.; de Groot, B. L.; van der Spoel, D. J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 3713. doi: 10.1021/ct100494z

    58. [58]

      (58) Wang, D. The Molecular Dynamics Simulations for Benzedrine to Move through the Phospholipid Bilayer Membrane. M. S. Dissertation, Yunnan University, Kunming, 2015. [王丹. 苯丙胺分子透过磷脂双层膜过程模拟研究[D]. 昆明: 云南大学, 2015.](58) Wang, D. The Molecular Dynamics Simulations for Benzedrine to Move through the Phospholipid Bilayer Membrane. M. S. Dissertation, Yunnan University, Kunming, 2015. [王丹. 苯丙胺分子透过磷脂双层膜过程模拟研究[D]. 昆明: 云南大学, 2015.]

    59. [59]

      (59) Marrink, S. J.; Berendsen, H. J. C. J. Phys. Chem. 1994, 98, 4155. doi: 10.1021/j100066a040(59) Marrink, S. J.; Berendsen, H. J. C. J. Phys. Chem. 1994, 98, 4155. doi: 10.1021/j100066a040

    60. [60]

      (60) Marrink, S. J.; Jaehnig, F.; Berendsen, H. J. C. Biophys. J. 1996, 71, 632. doi: 10.1016/S0006-3495(96)79264-0(60) Marrink, S. J.; Jaehnig, F.; Berendsen, H. J. C. Biophys. J. 1996, 71, 632. doi: 10.1016/S0006-3495(96)79264-0

    61. [61]

      (61) Zahn, D.; Brickmann, J. Chem. Phys. Lett. 2002, 352, 441. doi: 10.1016/S0009-2614(01)01437-3(61) Zahn, D.; Brickmann, J. Chem. Phys. Lett. 2002, 352, 441. doi: 10.1016/S0009-2614(01)01437-3

    62. [62]

      (62) Bemporad, D.; Essex, J.W.; Luttmann, C. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 4875. doi: 10.1021/jp035260s(62) Bemporad, D.; Essex, J.W.; Luttmann, C. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 4875. doi: 10.1021/jp035260s

    63. [63]

      (63) Shinoda, W.; Mikami, M.; Baba, T.; Hato, M. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 9346. doi: 10.1021/jp035998+(63) Shinoda, W.; Mikami, M.; Baba, T.; Hato, M. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 9346. doi: 10.1021/jp035998+

    64. [64]

      (64) Nichols, J.W.; Deamer, D.W. Proc. Nat. Acad. Sci. U. S. A. 1980, 77, 2038. doi: 10.1073/pnas.77.4.2038(64) Nichols, J.W.; Deamer, D.W. Proc. Nat. Acad. Sci. U. S. A. 1980, 77, 2038. doi: 10.1073/pnas.77.4.2038

    65. [65]

      (65) Benga, G.; Pop, V. I.; Popescu, O.; Borza, V. J. Biochem. Biophys. Methods 1990, 21, 87. doi: 10.1016/0165-022X(90)90057-J(65) Benga, G.; Pop, V. I.; Popescu, O.; Borza, V. J. Biochem. Biophys. Methods 1990, 21, 87. doi: 10.1016/0165-022X(90)90057-J

    66. [66]

      (66) Jansen, M.; Blume, A. Biophys. J. 1995, 68, 997. doi: 10.1016/S0006-3495(95)80275-4(66) Jansen, M.; Blume, A. Biophys. J. 1995, 68, 997. doi: 10.1016/S0006-3495(95)80275-4

    67. [67]

      (67) Andrasko, J.; Forsén, S. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1974, 60, 813. doi: 10.1016/0006-291X(74)90313-1(67) Andrasko, J.; Forsén, S. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1974, 60, 813. doi: 10.1016/0006-291X(74)90313-1

    68. [68]

      (68) Graziani, Y.; Livne, A. J. Membr. Biol. 1972, 7, 275. doi: 10.1007/BF01867920(68) Graziani, Y.; Livne, A. J. Membr. Biol. 1972, 7, 275. doi: 10.1007/BF01867920

    69. [69]

      (69) Khavrutskii, I. V.; Gorfe, A. A.; Lu, B.; McCammon, J. A. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 1706. doi: 10.1021/ja8081704(69) Khavrutskii, I. V.; Gorfe, A. A.; Lu, B.; McCammon, J. A. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 1706. doi: 10.1021/ja8081704

    70. [70]

      (70) Papahadjopoulos, D.; Nir, S.; Ohki, S. Biochim. Biophys. Acta 1972, 266, 561. doi: 10.1016/0005-2736(72)90354-9(70) Papahadjopoulos, D.; Nir, S.; Ohki, S. Biochim. Biophys. Acta 1972, 266, 561. doi: 10.1016/0005-2736(72)90354-9

  • 加载中
WeChat 扫一扫看文章
计量
  • PDF下载量:  1
  • 文章访问数:  385
  • HTML全文浏览量:  24
文章相关
  • 发布日期:  2016-01-14
  • 收稿日期:  2015-11-04
  • 网络出版日期:  2016-01-14
通讯作者: 陈斌, bchen63@163.com
  • 1. 

    沈阳化工大学材料科学与工程学院 沈阳 110142

  1. 本站搜索
  2. 百度学术搜索
  3. 万方数据库搜索
  4. CNKI搜索

/

返回文章

All Rights Reserved by the Chinese Chemical Society   中国化学会 版权所有 京ICP备05002797号

本系统由北京仁和汇智信息技术有限公司开发    技术支持: info@rhhz.net